RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 MAD2L2Q9UI95 211 aa9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 HPS5Q9UPZ3 1129 aa9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 RLFQ13129 1914 aa9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM232C9JQI7 657 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 PFKFB2O60825 505 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 AOC2O75106 756 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 PSEN1P49768 467 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF543Q08ER8 600 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 SCRN1Q12765 414 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 MOGSQ13724 837 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 TTBK2Q6IQ55 1244 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 BRI3BPQ8WY22 251 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 GTF3C6Q969F1 213 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 SNX21Q969T3 373 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 TMX3Q96JJ7 454 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 CPVLQ9H3G5 476 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 THSD7BQ9C0I4 1608 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 A0A0G2JMZ2 1700 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 USP17L15C9J2P7 530 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 BTBD19C9JJ37 291 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 USP17L11C9JVI0 530 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 KLRF2D3W0D1 207 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 USP17L18D6R9N7 530 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 USP17L22D6RA61 530 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 USP17L19D6RCP7 530 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 USP17L20D6RJB6 530 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 FLOT1O75955 427 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 PLEKHA8P1O95397 391 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 CDC27P30260 824 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 SLC16A2P36021 539 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 STAT2P52630 851 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 USP17L24Q0WX57 530 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 SREBF2Q12772 1141 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 NOGQ13253 232 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 PPP2R5BQ15173 497 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 GPAT2Q6NUI2 795 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 TMTC3Q6ZXV5 915 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 KIFC2Q96AC6 838 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 UBA5Q9GZZ9 404 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 FEM1BQ9UK73 627 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 PDHXO00330 501 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 CPLX1O14810 134 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 OSBPP22059 807 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 VEGFBP49765 207 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 GNAQP50148 359 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 ST3GAL1Q11201 340 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 SYDE2Q5VT97 1194 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD23Q86SG2 305 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 NBPF11Q86T75 865 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 FAM160B2Q86V87 743 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 CHURC1Q8WUH1 139 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 ZIC5Q96T25 663 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 PTPN18Q99952 460 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 SLF1Q9BQI6 1058 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 LZTS2Q9BRK4 669 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 VAT1LQ9HCJ6 419 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 FBXO28Q9NVF7 368 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 PNMA3Q9UL41 463 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.88□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 PLA2G6O60733 806 aa9.88□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 DTNBO60941 627 aa9.88□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 PPFIA3O75145 1194 aa9.88□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 CDKL5O76039 1030 aa9.88□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 INHBEP58166 350 aa9.88□□□□□ -0.83
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