RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 GAS7O60861 476 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 MUM1Q2TAK8 710 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 SH2D4BQ5SQS7 431 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 RPN1P04843 607 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 PTPROQ16827 1216 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM68Q6AZZ1 485 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 H7C1D1 291 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 SCRN1Q12765 414 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 MAP7Q14244 749 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 P3H4Q92791 437 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 SLC8A1P32418 973 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 MED23Q9ULK4 1368 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 ADAMTS12P58397 1594 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 MIER3Q7Z3K6 550 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 CHAMP1Q96JM3 812 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 SPATA1Q5VX52 437 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 ETF1P62495 437 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 RILPQ96NA2 401 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 TNKSO95271 1327 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 GIPC1O14908 333 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 RSAD2Q8WXG1 361 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 ATP1A2P50993 1020 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 PYCARDQ9ULZ3 195 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 OR52Z1P0C646 297 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 PDE6AP16499 860 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 PPP2R5CQ13362 524 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 PALM2Q8IXS6 379 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC13Q8IYE1 715 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 RAB20Q9NX57 234 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 BTBD18B2RXH4 712 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 FGAP02671 866 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 KRT12Q99456 494 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 CAPS2Q9BXY5 557 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 DPH5Q9H2P9 285 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 HAUS4Q9H6D7 363 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 USP40Q9NVE5 1235 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 SCG2P13521 617 aa23.45■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 PRR16Q569H4 304 aa23.45■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC125Q86Z20 511 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 GRK7Q8WTQ7 553 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 GABPAQ06546 454 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 ADCY8P40145 1251 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 HIP1RO75146 1068 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 CDC25BP30305 580 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 MAN1A1P33908 653 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 NEK8Q86SG6 692 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 SLC39A2Q9NP94 309 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 RASSF2P50749 326 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC24Q50LG9 513 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 IL17REQ8NFR9 667 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 CTAGE3PQ8IX95 158 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 ADGRL2O95490 1459 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 BCAMP50895 628 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 DDAH1O94760 285 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 TCP1P17987 556 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 GYG1P46976 350 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 BSPRYQ5W0U4 402 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 PNMA1Q8ND90 353 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 IWS1Q96ST2 819 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 NOD1Q9Y239 953 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA8HP0CJ92 632 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL14Q9P2G3 628 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 TTLL3Q9Y4R7 772 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-211ENST00000580170 ATP2A3Q93084 1043 aa23.43■■□□□ 1.34
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