RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555009.5

RPS6KL1-209, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RPS6KL1, Length 2,457 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-209ENST00000555009 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.89■□□□□ 0.94
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZBTB9Q96C00 473 aa20.89■□□□□ 0.94
RPS6KL1-209ENST00000555009 CALM1P0DP23 149 aa20.89■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 CALM2P0DP24 149 aa20.89■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 CALM3P0DP25 149 aa20.89■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 AMPD2Q01433 879 aa20.89■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.89■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 IQCA1Q86XH1 822 aa20.89■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 MYO6Q9UM54 1294 aa20.89■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.88■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 IL17AQ16552 155 aa20.88■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 GBP3Q9H0R5 595 aa20.88■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 KLRK1P26718 216 aa20.88■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 UBXN1Q04323 297 aa20.88■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 CASP8Q14790 479 aa20.88■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa20.88■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 CHP1Q99653 195 aa20.88■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 TSPYL1Q9H0U9 437 aa20.88■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 TUBBP07437 444 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 MCM7P33993 719 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 ACTN2P35609 894 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 MINPP1Q9UNW1 487 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 GNPATO15228 680 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 SLC20A2Q08357 652 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 RMND1Q9NWS8 449 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 DDAH1O94760 285 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 NDUFA10O95299 355 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 TRAPPC10P48553 1259 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 PRCPP42785 496 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 SLC51AQ86UW1 340 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 TRIM10Q9UDY6 481 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 GDAQ9Y2T3 454 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 NLRP5P59047 1200 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 USP21Q9UK80 565 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 FGRP09769 529 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 TTC26A0AVF1 554 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 H7C1D1 291 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 CACNA1SQ13698 1873 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 WDR93Q6P2C0 686 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 OR8K1Q8NGG5 319 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 NARFQ9UHQ1 456 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 SCG2P13521 617 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 CCDC102AQ96A19 550 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 ADAMTS3O15072 1205 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF384Q8TF68 577 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 PSMD14O00487 310 aa20.83■□□□□ 0.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 CTR9Q6PD62 1173 aa20.83■□□□□ 0.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.83■□□□□ 0.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 FAM71BQ8TC56 605 aa20.83■□□□□ 0.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.83■□□□□ 0.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.82■□□□□ 0.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 NMT2O60551 498 aa20.82■□□□□ 0.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 RPS6KA4O75676 772 aa20.82■□□□□ 0.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 MB21D1Q8N884 522 aa20.82■□□□□ 0.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 SETDB2Q96T68 719 aa20.82■□□□□ 0.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 DNAJC7Q99615 494 aa20.82■□□□□ 0.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 LCMT1Q9UIC8 334 aa20.82■□□□□ 0.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 ENC1O14682 589 aa20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms