RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549355.1

PTPRQ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRQ, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-204ENST00000549355 TOM1O60784 492 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 CAP2P40123 477 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 KIR3DL1P43629 444 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 MIPEPQ99797 713 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 ADGRL2O95490 1459 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 OR14I1A6ND48 311 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 ATP2B4P23634 1241 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 CDR1P51861 262 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 CPS1P31327 1500 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 UGGT1Q9NYU2 1555 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 MED14O60244 1454 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 PTPN23Q9H3S7 1636 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 C6P13671 934 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 VIPR1P32241 457 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 ABCC3O15438 1527 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 LMTK2Q8IWU2 1503 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 ERVK-7P63135 1459 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 CYR61O00622 381 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 FFAR3O14843 346 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 SLURP1P55000 103 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 NKG7Q16617 165 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 Q96M66 194 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 MYO3AQ8NEV4 1616 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 ATG7O95352 703 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 GPR160Q9UJ42 338 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM2Q9UHN6 1383 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 TACR2P21452 398 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 NME2P22392 152 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 CAP1Q01518 475 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 EGR3Q06889 387 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 CPZQ66K79 652 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 NLRX1Q86UT6 975 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 FERMT3Q86UX7 667 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 MZB1Q8WU39 189 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 DEPDC5O75140 1603 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 ITGB3P05106 788 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 GDF5P43026 501 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 KCNC1P48547 511 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 PLCB3Q01970 1234 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 UBXN11Q5T124 520 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 PWWP2AQ96N64 755 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF20P17024 532 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 AAMPQ13685 434 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 IDI1Q13907 227 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 GRM2Q14416 872 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 ADGRF1Q5T601 910 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 SLIT1O75093 1534 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 NUP155O75694 1391 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 LTBP4Q8N2S1 1624 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 NOS1P29475 1434 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 ARHGAP23Q9P227 1491 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 STRCQ7RTU9 1775 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 CHRNEQ04844 493 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 PIK3R4Q99570 1358 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 EFCAB6Q5THR3 1501 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 VWDEQ8N2E2 1590 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM13AO94988 1023 aa6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms