RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527773.1

LGR4-205, Transcript of leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 4, human

TSL 2

Gene LGR4, Length 420 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LGR4-205	ENST00000527773	GIPC2	Q8TF65	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	EDEM1	Q92611	657 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	TOX2	Q96NM4	488 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	CDK19	Q9BWU1	502 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	DCTPP1	Q9H773	170 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	SEPT3	Q9UH03	358 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	PIK3C2A	O00443	1686 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	SBNO1	A3KN83	1393 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	CHL1	O00533	1208 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	CDC45	O75419	566 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	LEFTY1	O75610	366 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	FAM87A	P0C7U9	286 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	OXCT1	P55809	520 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	AOX1	Q06278	1338 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	CDK5R2	Q13319	367 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	ABTB2	Q8N961	1025 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	TNR	Q92752	1358 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LGR4-205	ENST00000527773	NFAT5	O94916	1531 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	MRC1	P22897	1456 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	FLT4	P35916	1363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	MSH6	P52701	1360 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	C1QTNF9	P0C862	333 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	ZNF445	P59923	1031 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	RABEP1	Q15276	862 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	AOC3	Q16853	763 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	HSCB	Q8IWL3	235 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	WDR18	Q9BV38	432 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	GRIA4	P48058	902 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	TERF1	P54274	439 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	PCDH1	Q08174	1060 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	POU4F3	Q15319	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	TTC22	Q5TAA0	569 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	CEP85	Q6P2H3	762 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	PMEPA1	Q969W9	287 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	SLIT3	O75094	1523 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	AOC2	O75106	756 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	TNFRSF21	O75509	655 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	ANAPC15	P60006	121 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	CUL4A	Q13619	759 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LGR4-205	ENST00000527773	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68

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