RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.65□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 RFXAPO00287 272 aa8.65□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 ZNF385BQ569K4 471 aa8.65□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 NKD1Q969G9 470 aa8.65□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 TNFRSF10CO14798 259 aa8.64□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 RTP1P59025 263 aa8.64□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 ZPBP2Q6X784 338 aa8.64□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 SLC6A18Q96N87 628 aa8.64□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 NT5C1AQ9BXI3 368 aa8.64□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.64□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa8.64□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 PNLIPP16233 465 aa8.63□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 OLFML2BQ68BL8 750 aa8.63□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 SLITRK4Q8IW52 837 aa8.63□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 TMEM192Q8IY95 271 aa8.63□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 ANTXR1Q9H6X2 564 aa8.63□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.63□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.63□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 MINPP1Q9UNW1 487 aa8.63□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 KCTD3Q9Y597 815 aa8.63□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 TAF6LQ9Y6J9 622 aa8.63□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 MEIS1O00470 390 aa8.62□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 TCERG1LQ5VWI1 586 aa8.62□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 GALNT18Q6P9A2 607 aa8.62□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8.62□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.62□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 FADS2P1A8MWK0 482 aa8.61□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 BMP8BP34820 402 aa8.61□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 TMEM151BQ8IW70 566 aa8.61□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.61□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 SPON2Q9BUD6 331 aa8.61□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 PRR13Q9NZ81 148 aa8.61□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 ABLIM1O14639 778 aa8.6□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 ARL4AP40617 200 aa8.6□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 ERVFRD-1P60508 538 aa8.6□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 AUHQ13825 339 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 SSPNQ14714 243 aa8.6□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 SIGLEC10Q96LC7 697 aa8.6□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.6□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 IRAK3Q9Y616 596 aa8.6□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 NCANO14594 1321 aa8.59□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 ZNF205O95201 554 aa8.59□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 SDHBP21912 280 aa8.59□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 VIPR1P32241 457 aa8.59□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 CTSWP56202 376 aa8.59□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 YBX1P67809 324 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 TMEM87AQ8NBN3 555 aa8.59□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 DHRS1Q96LJ7 313 aa8.59□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 SLC9A7Q96T83 725 aa8.59□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.59□□□□□ -1.03
SGCE-211ENST00000522045 B8ZZF3 427 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 PRRG2O14669 202 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 MPOP05164 745 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 BMP7P18075 431 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 PI3P19957 117 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 HOXA5P20719 270 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 CTSKP43235 329 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 LAPTM5Q13571 262 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 CRTC3Q6UUV7 619 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 PARD6AQ9NPB6 346 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PQY0 241 aa8.57□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 N4BP3O15049 544 aa8.57□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 IMPDH2P12268 514 aa8.57□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 TMEM62Q0P6H9 643 aa8.57□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 SLCO6A1Q86UG4 719 aa8.57□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 DSCC1Q9BVC3 393 aa8.57□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 CNTD2Q9H8S5 307 aa8.57□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 ZNRF3Q9ULT6 936 aa8.57□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 FAM86C2PA6NEL3 165 aa8.56□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 GSNP06396 782 aa8.56□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 VAV1P15498 845 aa8.56□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 EPHB3P54753 998 aa8.56□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa8.56□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.56□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.56□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 ADAMTS20P59510 1910 aa8.55□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 ACRP10323 421 aa8.55□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 PRKCAP17252 672 aa8.55□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 ZNF76P36508 570 aa8.55□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 KIR3DS1Q14943 382 aa8.55□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 NUP43Q8NFH3 380 aa8.55□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 CYP4F8P98187 520 aa8.54□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 KCNC2Q96PR1 638 aa8.54□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.54□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.54□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.54□□□□□ -1.04
SGCE-211ENST00000522045 C9IYK1 514 aa8.53□□□□□ -1.04
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