RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 SGSM2O43147 1006 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 COBLO75128 1261 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC1A4P43007 532 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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SH3BP2-218ENST00000511185 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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SH3BP2-218ENST00000511185 MROH8Q9H579 483 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.07■■□□□ 1.12
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SH3BP2-218ENST00000511185 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.07■■□□□ 1.12
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SH3BP2-218ENST00000511185 STAT2P52630 851 aa22.06■■□□□ 1.12
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SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC96Q2M329 555 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 CPXCR1Q8N123 301 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 RPTORQ8N122 1335 aa22.06■■□□□ 1.12
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SH3BP2-218ENST00000511185 PGK2P07205 417 aa22.05■■□□□ 1.12
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SH3BP2-218ENST00000511185 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 ESR2Q92731 530 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF536O15090 1300 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A27O95847 323 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP21A2P08686 494 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC4A3P48751 1232 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 TRPV1Q8NER1 839 aa22.04■■□□□ 1.12
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SH3BP2-218ENST00000511185 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 PDHBP11177 359 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 DPP9Q86TI2 863 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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SH3BP2-218ENST00000511185 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP2A1O14983 1001 aa22.02■■□□□ 1.12
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SH3BP2-218ENST00000511185 ZBED4O75132 1171 aa22.02■■□□□ 1.12
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SH3BP2-218ENST00000511185 SLC16A2P36021 539 aa22.02■■□□□ 1.12
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SH3BP2-218ENST00000511185 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 TNKSO95271 1327 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-218ENST00000511185 CYBAP13498 195 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC174Q6PII3 467 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM160B2Q86V87 743 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 MAML3Q96JK9 1138 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.01■■□□□ 1.11
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SH3BP2-218ENST00000511185 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 KCTD2Q14681 263 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 OLFML2BQ68BL8 750 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 CPVLQ9H3G5 476 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAH12Q6ZR08 3092 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 PLA2G6O60733 806 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 SNHG28P0DPA3 235 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 COPB2P35606 906 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 OAZ1P54368 228 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF543Q08ER8 600 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 CHURC1Q8WUH1 139 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 CEP290O15078 2479 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA8HP0CJ92 632 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF792Q3KQV3 632 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 LHX8Q68G74 356 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 IQCA1Q86XH1 822 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 PNMA1Q8ND90 353 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP4K1Q92918 833 aa21.98■■□□□ 1.11
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