RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-240ENST00000495293 AFMP43652 599 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 LIG3P49916 1009 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 FAM161BQ96MY7 647 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 UBR1Q8IWV7 1749 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 PIK3C2BO00750 1634 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 TMEM2Q9UHN6 1383 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 PKN1Q16512 942 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 AK5Q9Y6K8 562 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 SYNMO15061 1565 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 ADGRB3O60242 1522 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 F6X3S4 739 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 TSPAN15O95858 294 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 PGRP06401 933 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 TMEM87BQ96K49 555 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 SLC38A3Q99624 504 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 SP110Q9HB58 689 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 MED14O60244 1454 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 SLIT1O75093 1534 aa6.46□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 IQGAP1P46940 1657 aa6.46□□□□□ -1.37
RBM39-240ENST00000495293 CTSHP09668 335 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 LTKP29376 864 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 DIRC2Q96SL1 478 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 CCDC144AA2RUR9 1427 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 RIMS2Q9UQ26 1411 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 C1QTNF9P0C862 333 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 GAB4Q2WGN9 574 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 FBXO41Q8TF61 875 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 FRMD6Q96NE9 622 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 PARP2Q9UGN5 583 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 ARHGAP23Q9P227 1491 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 KIF1BO60333 1816 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 TRPM2O94759 1503 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 KIR3DL1P43629 444 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 RAP1GAPP47736 663 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 CCDC27Q2M243 656 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 NEURL4Q96JN8 1562 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 MYO5BQ9ULV0 1848 aa6.43□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 LRRN2O75325 713 aa6.43□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 HK2P52789 917 aa6.43□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 RGL3Q3MIN7 710 aa6.43□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.43□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 SLC6A19Q695T7 634 aa6.43□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 TTC6Q86TZ1 520 aa6.43□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 PHC3Q8NDX5 983 aa6.43□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 CPS1P31327 1500 aa6.43□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa6.43□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 TOM1O60784 492 aa6.42□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 SRFP11831 508 aa6.42□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 KCNA6P17658 529 aa6.42□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.42□□□□□ -1.38
RBM39-240ENST00000495293 TBX22Q9Y458 520 aa6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms