RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 NETO1Q8TDF5 533 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 SH3TC2Q8TF17 1288 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 BRF1Q92994 677 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 CHST7Q9NS84 486 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 AKT3Q9Y243 479 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 ST14Q9Y5Y6 855 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PQU0 124 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa7.34□□□□□ -1.23
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CCL20-204ENST00000489160 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.34□□□□□ -1.23
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CCL20-204ENST00000489160 HDAC8Q9BY41 377 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
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CCL20-204ENST00000489160 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
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CCL20-204ENST00000489160 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.33□□□□□ -1.24
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CCL20-204ENST00000489160 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 DAGLBQ8NCG7 672 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 MISP3Q96FF7 219 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 ENPP3O14638 875 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 ADCY3O60266 1144 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 PRNPP04156 253 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 GSNP06396 782 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 PPP2R2AP63151 447 aa7.32□□□□□ -1.24
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CCL20-204ENST00000489160 TRIM59Q8IWR1 403 aa7.32□□□□□ -1.24
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CCL20-204ENST00000489160 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa7.32□□□□□ -1.24
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CCL20-204ENST00000489160 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.31□□□□□ -1.24
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CCL20-204ENST00000489160 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 H0Y8X5 98 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 MEIS1O00470 390 aa7.3□□□□□ -1.24
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CCL20-204ENST00000489160 WNT11O96014 354 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 HSD3B2P26439 372 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 POU4F1Q01851 419 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 SQSTM1Q13501 440 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 TMEM67Q5HYA8 995 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 HOMER1Q86YM7 354 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 APPBP2Q92624 585 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 TCTN2Q96GX1 697 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 KANSL2Q9H9L4 492 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 SEMA3GQ9NS98 782 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 VAV3Q9UKW4 847 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 MINPP1Q9UNW1 487 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa7.29□□□□□ -1.24
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CCL20-204ENST00000489160 CDC45O75419 566 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 CAPNS1P04632 268 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 BMP8BP34820 402 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 CTSKP43235 329 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 AMPD2Q01433 879 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 PRKCQQ04759 706 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 GAB4Q2WGN9 574 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 CRTC3Q6UUV7 619 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 UBE2FQ969M7 185 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.29□□□□□ -1.24
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