RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472943.5

LINC00886-201, long intergenic non-protein coding RNA 886, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00886, Length 3,306 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00886-201ENST00000472943 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 PIGBQ92521 554 aa11.63□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 PRDM11Q9NQV5 511 aa11.63□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 CACNA1SQ13698 1873 aa11.63□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa11.63□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 LGALS16A8MUM7 142 aa11.63□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 H7C1D1 291 aa11.63□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 ADAMTS3O15072 1205 aa11.63□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 PPFIA4O75335 1185 aa11.63□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF662Q6ZS27 426 aa11.63□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 RMND1Q9NWS8 449 aa11.63□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 CAPN11Q9UMQ6 739 aa11.63□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 A0A1B0GUL6 1792 aa11.63□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 A0A1W2PQC6 194 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 MYBL2P10244 700 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 PMS1P54277 932 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 CATIPQ7Z7H3 387 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 PACS2Q86VP3 889 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 CAPZA3Q96KX2 299 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 TMTC3Q6ZXV5 915 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 ADSSL1Q8N142 457 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 CARD10Q9BWT7 1032 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 RREB1Q92766 1687 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 RCCD1A6NED2 376 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 ANKRD65E5RJM6 399 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 AGPSO00116 658 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 ZMYND10O75800 440 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 MCM7P33993 719 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 GGCXP38435 758 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 STIM1Q13586 685 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 MEA1Q16626 185 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 JAKMIP2Q96AA8 810 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 LRP2BPQ9P2M1 347 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 CYP7A1P22680 504 aa11.61□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 TTYH3Q9C0H2 523 aa11.61□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 LACRTQ9GZZ8 138 aa11.61□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa11.61□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF185O15231 689 aa11.61□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 TRAPPC10P48553 1259 aa11.61□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 PLCD3Q8N3E9 789 aa11.61□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 SLC4A9Q96Q91 983 aa11.61□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 SELENOOQ9BVL4 669 aa11.61□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa11.61□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 MYH10P35580 1976 aa11.61□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 PHLPP1O60346 1717 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 KRT83P78385 493 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 CTR9Q6PD62 1173 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 C4orf32Q8N8J7 132 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 ABCA3Q99758 1704 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 RASSF10A6NK89 507 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 KRT86O43790 486 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 CALM1P0DP23 149 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 CALM2P0DP24 149 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 CALM3P0DP25 149 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 EHBP1Q8NDI1 1231 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 THAP9Q9H5L6 903 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 LAMB1P07942 1786 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 DDAH1O94760 285 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 LONP1P36776 959 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 STAT6P42226 847 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 NAALADL2Q58DX5 795 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 KIAA1328Q86T90 577 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 PPM1EQ8WY54 764 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 DUSP10Q9Y6W6 482 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 KAT6BQ8WYB5 2073 aa11.59□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 DISC1Q9NRI5 854 aa11.59□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 COL4A1P02462 1669 aa11.59□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 ANO9A1A5B4 782 aa11.59□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 PES1O00541 588 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
LINC00886-201ENST00000472943 KLRC4O43908 158 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms