RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 ZDHHC15Q96MV8 337 aa7.16□□□□□ -1.26
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PRPF40A-208ENST00000472760 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa7.1□□□□□ -1.27
PRPF40A-208ENST00000472760 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.1□□□□□ -1.27
PRPF40A-208ENST00000472760 MISP3Q96FF7 219 aa7.1□□□□□ -1.27
PRPF40A-208ENST00000472760 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PRPF40A-208ENST00000472760 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.09□□□□□ -1.27
PRPF40A-208ENST00000472760 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.09□□□□□ -1.27
PRPF40A-208ENST00000472760 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
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