RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 DHCR24Q15392 516 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 SPRED3Q2MJR0 410 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 BBS9Q3SYG4 887 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 SGO2Q562F6 1265 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM102BQ5T8I3 360 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 RUFY4Q6ZNE9 571 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 VN1R5Q7Z5H4 357 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 SULF2Q8IWU5 870 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 SCUBE1Q8IWY4 988 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 FBXL6Q8N531 539 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 UBR7Q8N806 425 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC39A13Q96H72 371 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 MFSD14AQ96MC6 490 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 SENP7Q9BQF6 1050 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 GMIPQ9P107 970 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 ANAPC4Q9UJX5 808 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 UPK3BL1B0FP48 263 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 UPK3BL2E5RIL1 263 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 GPR39O43194 453 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 KATNA1O75449 491 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 FLT3P36888 993 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 FAAP100Q0VG06 881 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 RAPGEF1Q13905 1077 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 MLC1Q15049 377 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 NFKBIBQ15653 356 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 LCE3BQ5TA77 95 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 CNNM4Q6P4Q7 775 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 PAOXQ6QHF9 649 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC4A10Q6U841 1118 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 KSR2Q6VAB6 950 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 C14orf80Q86SX3 495 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 DGKHQ86XP1 1220 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 DTX1Q86Y01 620 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 MTMR8Q96EF0 704 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 YIPF2Q9BWQ6 316 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 CBX8Q9HC52 389 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 PRDM11Q9NQV5 511 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 PIM2Q9P1W9 311 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 PNMA2Q9UL42 364 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 TACC3Q9Y6A5 838 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 CUX2O14529 1486 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 NPHP1O15259 732 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 GRIN3BO60391 1043 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 EFCAB14O75071 495 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 RAPGEF3O95398 923 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 B3GALT4O96024 378 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 NME1P15531 152 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 PDE4BQ07343 736 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 AP3B2Q13367 1082 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 MTMR1Q13613 665 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 LRRC41Q15345 812 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 RGL3Q3MIN7 710 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 KIAA1211LQ6NV74 962 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 CLEC4GQ6UXB4 293 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 UNC5AQ6ZN44 842 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 IFNL3Q8IZI9 196 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 MAGEB6Q8N7X4 407 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 GAL3ST3Q96A11 431 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 ARPC5LQ9BPX5 153 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 SUGCTQ9HAC7 445 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF180Q9UJW8 692 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 METTL12A8MUP2 240 aa4.28□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 TNFRSF10CO14798 259 aa4.28□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 NRDCO43847 1150 aa4.28□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 ZEB2O60315 1214 aa4.28□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 ADAMTS4O75173 837 aa4.28□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 HTR3BO95264 441 aa4.28□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 FGAP02671 866 aa4.28□□□□□ -1.72
ANKRD28-205ENST00000460278 F13BP05160 661 aa4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms