RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435328.1

RAPGEF4-AS1-202, RAPGEF4 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAPGEF4-AS1, Length 4,625 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TNFAIP3P21580 790 aa14.53□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TRAPPC10P48553 1259 aa14.53□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.53□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.53□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 VSNL1P62760 191 aa14.53□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 PDCLQ13371 301 aa14.53□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 DRP2Q13474 957 aa14.53□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.53□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 KRT12Q99456 494 aa14.53□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 SASH1O94885 1247 aa14.52□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.52□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 STX2P32856 288 aa14.52□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TCP11Q8WWU5 503 aa14.52□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 GBP5Q96PP8 586 aa14.52□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CUEDC2Q9H467 287 aa14.52□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.52□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 MUM1Q2TAK8 710 aa14.52□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.52□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 BUB1O43683 1085 aa14.51□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 MMP1P03956 469 aa14.51□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CCDC174Q6PII3 467 aa14.51□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa14.51□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.51□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 IFNAR1P17181 557 aa14.51□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 KRT31Q15323 416 aa14.51□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 THAP9Q9H5L6 903 aa14.51□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 PTGDRQ13258 359 aa14.51□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.51□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 SH2D4BQ5SQS7 431 aa14.51□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.51□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 SPOPO43791 374 aa14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 PTPREP23469 700 aa14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CCDC62Q6P9F0 684 aa14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 FUT8Q9BYC5 575 aa14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 B4DLN1 442 aa14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 BIRC3Q13489 604 aa14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 UBE3CQ15386 1083 aa14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 HINFPQ9BQA5 517 aa14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 KIF3CO14782 793 aa14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 AP5Z1O43299 807 aa14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CUL1Q13616 776 aa14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 SMIM24O75264 130 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TNNI2P48788 182 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ZNF131P52739 623 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 VPS52Q8N1B4 723 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 LPIN2Q92539 896 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 EHHADHQ08426 723 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 SAAL1Q96ER3 474 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 WDR19Q8NEZ3 1342 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 KCNQ3O43525 872 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 GCP02774 474 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ZNF365Q70YC5 407 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CCDC105Q8IYK2 499 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 KLHL29Q96CT2 875 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 PAGE5Q96GU1 130 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TRIM4Q9C037 500 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 VCX3BQ9H321 246 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 KLC4Q9NSK0 619 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14.49□□□□□ -0.09
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CIAO1O76071 339 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms