RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 OAS2P29728 719 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 KCNQ3O43525 872 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 NR1I2O75469 434 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 BCAMP50895 628 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 YARSP54577 528 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 EPSTI1Q96J88 318 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 USP21Q9UK80 565 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 FGAP02671 866 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 ALAS1P13196 640 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 LIG4P49917 911 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 PNMA2Q9UL42 364 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 FBXO11Q86XK2 927 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 RABEP2Q9H5N1 569 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 APBA3O96018 575 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 IFNB1P01574 187 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 BRD3Q15059 726 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 GSDMBQ8TAX9 411 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 RSAD2Q8WXG1 361 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 C1orf112Q9NSG2 853 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 ABCC2Q92887 1545 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 PSMD6Q15008 389 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 XKR9Q5GH70 373 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 CTAGE3PQ8IX95 158 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 PANK4Q9NVE7 773 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 BTBD18B2RXH4 712 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 RIC8AQ9NPQ8 531 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 RAB20Q9NX57 234 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 RNF40O75150 1001 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 MAN1A1P33908 653 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 SEPT6Q14141 434 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 DCAF15Q66K64 600 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 SPC25Q9HBM1 224 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 KCNK3O14649 394 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 UBE3CQ15386 1083 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 NUF2Q9BZD4 464 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 MED23Q9ULK4 1368 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 SARNPP82979 210 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 ICA1Q05084 483 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 PPP2R5CQ13362 524 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 METTL13Q8N6R0 699 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 FLAD1Q8NFF5 587 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 PALD1Q9ULE6 856 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 K7ENM7 598 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 HADHQ16836 314 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 BSPRYQ5W0U4 402 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 LRRC24Q50LG9 513 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 GRK7Q8WTQ7 553 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 KRIT1O00522 736 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 TNNC2P02585 160 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 BTDP43251 543 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 VCXQ9H320 206 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 STX2P32856 288 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 CHRNDQ07001 517 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 PALM2Q8IXS6 379 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 TEKT3Q9BXF9 490 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 SPATA1Q5VX52 437 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 COPRSQ9NQ92 184 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.33■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 TCP1P17987 556 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 ADPGKQ9BRR6 497 aa20.33■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 DESI2Q9BSY9 194 aa20.33■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa20.33■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 ZNF827Q17R98 1081 aa20.33■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
USP25-204ENST00000400183 ADCY9O60503 1353 aa20.33■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms