RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364561.1

RNU6-1277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1277P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGKV1-17P01599 117 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MMP9P14780 707 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ADRA2BP18089 450 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LMNB1P20700 586 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BMP8BP34820 402 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF84P51523 738 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MAP3K12Q12852 859 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DUSP8Q13202 625 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ICAM4Q14773 271 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRAPPC3LQ5T215 181 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMEM132EQ6IEE7 984 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FBXO42Q6P3S6 717 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RNF111Q6ZNA4 994 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 USP48Q86UV5 1035 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF248Q8NDW4 579 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SSC4DQ8WTU2 575 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF700Q9H0M5 742 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C7orf69Q9H7B7 122 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PDE11AQ9HCR9 933 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CEP126Q9P2H0 1117 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SALL4Q9UJQ4 1053 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRRT4C9JH25 899 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TP73O15350 636 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DHX15O43143 795 aaKnown RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CYP26A1O43174 497 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TLL1O43897 1013 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CD5P06127 495 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DRD3P35462 400 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF75DP51815 510 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DGKQP52824 942 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLURP1P55000 103 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RAC1P63000 192 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LMAN2Q12907 356 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RIN1Q13671 783 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ARMCX5Q6P1M9 558 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FRRS1Q6ZNA5 592 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 Q6ZPA2 131 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GTSCR1Q86UQ5 136 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 P3H2Q8IVL5 708 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 REXO1L1PQ8IX06 675 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GPR135Q8IZ08 494 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 STK11IPQ8N1F8 1099 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LINC00528Q8N1L1 170 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C17orf47Q8NEP4 570 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FBXO30Q8TB52 745 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RFT1Q96AA3 541 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HIC2Q96JB3 615 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF586Q9NXT0 402 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SUFUQ9UMX1 484 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IRAK3Q9Y616 596 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HS3ST4Q9Y661 456 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1277P-201ENST00000364561 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa-1.47□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CROCCQ5TZA2 2017 aa-1.47□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A0A1W2PPI3 338 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MYMKA6NI61 221 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NEURL1BA8MQ27 555 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 F8VVB4 439 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 F8VWA3 439 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF432O94892 652 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C8BP07358 591 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF883P0CG24 379 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 VARSP26640 1264 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC5A2P31639 672 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CIITAP33076 1130 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CPOXP36551 454 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 WDR4P57081 412 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TEKQ02763 1124 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C14orf177Q52M58 125 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC23A3Q6PIS1 610 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LIMS2Q7Z4I7 341 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRT73Q86Y46 540 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF584Q8IVC4 421 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RIN3Q8TB24 985 aa-1.48□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms