RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362821.1

RN7SKP173-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 173, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP173, Length 315 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP173-201ENST00000362821 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 FAM83BQ5T0W9 1011 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 SYDE2Q5VT97 1194 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 WWC2Q6AWC2 1192 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 TTBK2Q6IQ55 1244 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 GALNT17Q6IS24 598 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 FAM173BQ6P4H8 233 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 SPATA32Q96LK8 384 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 WDR18Q9BV38 432 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 JMJD4Q9H9V9 463 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 POTECB2RU33 542 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 BTBD18B2RXH4 712 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 WDR46O15213 610 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 USP2O75604 605 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 MAP3K9P80192 1104 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 TRAF1Q13077 416 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 MTMR2Q13614 643 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 BTNL9Q6UXG8 535 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 FAM160B2Q86V87 743 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 ZNF280CQ8ND82 737 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 CHURC1Q8WUH1 139 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 C6orf50Q9HD87 102 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 FEM1BQ9UK73 627 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 PCDHA4Q9UN74 947 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 FZD1Q9UP38 647 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 ZHX2Q9Y6X8 837 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 ELP1O95163 1332 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 ESYT2A0FGR8 921 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 TRIM75PA6NK02 468 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 MBD3O95983 291 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 GNA11P29992 359 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 SPP2Q13103 211 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 NR5A1Q13285 461 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 VGLL4Q14135 290 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 QRICH1Q2TAL8 776 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 RILPL1Q5EBL4 403 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 DLK2Q6UY11 383 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 ARMC9Q7Z3E5 817 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 LDHDQ86WU2 507 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 BLIDQ8IZY5 108 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 DAGLBQ8NCG7 672 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 BICD2Q8TD16 824 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 OXER1Q8TDS5 423 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 MTMR8Q96EF0 704 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 TANGO6Q9C0B7 1094 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 RRAGCQ9HB90 399 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 LMBRD1Q9NUN5 540 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 C19orf81C9J6K1 198 aa9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 TRAK2O60296 914 aa9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 PLA2G6O60733 806 aa9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 ADCY7P51828 1080 aa9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 BACE1P56817 501 aa9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 STK38Q15208 465 aa9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 FBXO11Q86XK2 927 aa9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 KIFC2Q96AC6 838 aa9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 SHISA4Q96DD7 197 aa9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 USP28Q96RU2 1077 aa9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 AMNQ9BXJ7 453 aa9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 ZMYND12Q9H0C1 365 aa9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 GLT8D2Q9H1C3 349 aa9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 POLR3EQ9NVU0 708 aa9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa9.92□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 SMCO2A6NFE2 343 aa9.92□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 YEATS4O95619 227 aa9.92□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 POTEIP0CG38 1075 aa9.92□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 POTEJP0CG39 1038 aa9.92□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 VCAM1P19320 739 aa9.92□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 NASPP49321 788 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 UBE2HP62256 183 aa9.92□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 NPY5RQ15761 445 aa9.92□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 ANO1Q5XXA6 986 aa9.92□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.92□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RN7SKP173-201ENST00000362821 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms