RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 HELLSQ9NRZ9 838 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PAPPAQ13219 1627 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PGK2P07205 417 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 MARK3P27448 753 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SYDE2Q5VT97 1194 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ATG9AQ7Z3C6 839 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 OR6J1Q8NGC5 347 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 FAM200AQ8TCP9 573 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ACER1Q8TDN7 264 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SOCS4Q8WXH5 440 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 FAM227BQ96M60 508 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R16BQ96T49 567 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 TXNP10599 105 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 HACE1Q8IYU2 909 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 RMDN3Q96TC7 470 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 MYL10Q9BUA6 226 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PDCL3Q9H2J4 239 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SLC28A3Q9HAS3 691 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 V9GY48 417 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SDK1Q7Z5N4 2213 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CTSHP09668 335 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 MB21D1Q8N884 522 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 LPAR1Q92633 364 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CEP89Q96ST8 783 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 C22orf23Q9BZE7 217 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 FBXO28Q9NVF7 368 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 POLIQ9UNA4 740 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 NHSQ6T4R5 1651 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SEC24BO95487 1268 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 GNAT1P11488 350 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 IDEP14735 1019 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PRMT2P55345 433 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 STXBP2Q15833 593 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 MAEAQ7L5Y9 396 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC155Q8N6L0 562 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SLAIN1Q8ND83 568 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ERMNQ8TAM6 284 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 BICD2Q8TD16 824 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 OSBPL3Q9H4L5 887 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 STAP2Q9UGK3 403 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 FEM1BQ9UK73 627 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 USP2O75604 605 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 INHAP05111 366 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 IL1R1P14778 569 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PTPRAP18433 802 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 TNFAIP2Q03169 654 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 STK38Q15208 465 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CERS5Q8N5B7 392 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 HAUS7Q99871 368 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 APOL6Q9BWW8 343 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 GBP3Q9H0R5 595 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PSTPIP2Q9H939 334 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 IRS2Q9Y4H2 1338 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SPDYE5A6NIY4 337 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 WDR46O15213 610 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 MSCO60682 206 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ADD2P35612 726 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PRKCZQ05513 592 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 VCPKMTQ9H867 229 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 AKT3Q9Y243 479 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 FLT1P17948 1338 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 BRWD3Q6RI45 1802 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 TLR2O60603 784 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 HMGCRP04035 888 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 AOX1Q06278 1338 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 TJP1Q07157 1748 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 LETM2Q2VYF4 491 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 AK9Q5TCS8 1911 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 FAM205AQ6ZU69 1335 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SLC17A8Q8NDX2 589 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 C8orf76Q96K31 380 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SGIP1Q9BQI5 828 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D2Q9BYX2 928 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 RTL9Q8NET4 1388 aa5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms