RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 SKOR1P84550 965 aa24.55■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 MSL1Q68DK7 614 aa24.55■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 CCDC125Q86Z20 511 aa24.55■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 CCDC13Q8IYE1 715 aa24.55■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 TC2NQ8N9U0 490 aa24.55■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.525e-8■■■■□ 24.5
PITX1-201ENST00000265340 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 ZEB2O60315 1214 aa24.55■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 FGAP02671 866 aa24.55■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 SLC5A1P13866 664 aa24.55■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 HAND2P61296 217 aa24.55■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 CCDC148Q8NFR7 591 aa24.55■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 SPDL1Q96EA4 605 aa24.55■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 RASGRF1Q13972 1273 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 CENPHQ9H3R5 247 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 GGA2Q9UJY4 613 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 NEDD4P46934 1319 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 TMEM232C9JQI7 657 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 RAB27AP51159 221 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 CHRNDQ07001 517 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 BRAPQ7Z569 592 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 FAM228AQ86W67 206 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 DESI2Q9BSY9 194 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 A0A1W2PQ27 194 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 A0A1W2PQ64 194 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 A0A1W2PQD8 194 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 TBC1D25Q3MII6 688 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 FILIP1LQ4L180 1135 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 CHST3Q7LGC8 479 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 OR8K1Q8NGG5 319 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 HOOK2Q96ED9 719 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 RABEP2Q9H5N1 569 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 ME1P48163 572 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 BCAMP50895 628 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 ZBTB10Q96DT7 871 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 USP28Q96RU2 1077 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 CASZ1Q86V15 1759 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA8KD6RF30 607 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 SPATA5Q8NB90 893 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 PES1O00541 588 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 USP14P54578 494 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 MYL5Q02045 173 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 PSMD2Q13200 908 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 JAK2O60674 1132 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 PDHBP11177 359 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 PDE6AP16499 860 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 KIRREL3Q8IZU9 778 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 ZNF569Q5MCW4 686 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 ADALQ6DHV7 355 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 CYB5D1Q6P9G0 228 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 FANCLQ9NW38 375 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 MTA1Q13330 715 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 ILDR2Q71H61 639 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 LZTFL1Q9NQ48 299 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 RGL2O15211 777 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 PDILTQ8N807 584 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 ADGRG1Q9Y653 693 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA6BA6NDN3 693 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 BIN1O00499 593 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 KCNB1Q14721 858 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 UBE3CQ15386 1083 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 INTS13Q9NVM9 706 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 PEX19P40855 299 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 IFFO1Q0D2I5 559 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
PITX1-201ENST00000265340 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms