RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 TPH2Q8IWU9 490 aa11.6□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 WDR19Q8NEZ3 1342 aa11.6□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 BICDL2A1A5D9 508 aa11.6□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 EEF2KMTQ96G04 330 aa11.6□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 DPCR1Q3MIW9 517 aa11.6□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 GADL1Q6ZQY3 521 aa11.6□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 CCDC65Q8IXS2 484 aa11.6□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 BCL2L12Q9HB09 334 aa11.6□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 TRAF5O00463 557 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 DPEP1P16444 411 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 RIC1Q4ADV7 1423 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 DGKHQ86XP1 1220 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 CCPG1Q9ULG6 757 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 HAUS3Q68CZ6 603 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 VGLL2Q8N8G2 317 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM260Q9NX78 707 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 POLR2MP0CAP2 368 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 BMP3P12645 472 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 EEF2P13639 858 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 GNG11P61952 73 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 A0A1W2PQ27 194 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 A0A1W2PQ64 194 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 A0A1W2PQD8 194 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 FAM170AA1A519 330 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 DDR1Q08345 913 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 LONRF3Q496Y0 759 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 MLKLQ8NB16 471 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 PCDHA12Q9UN75 941 aa11.59□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 USP17L10C9JJH3 530 aa11.58□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 SPAG1Q07617 926 aa11.58□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 SYDE2Q5VT97 1194 aa11.58□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 CNNM4Q6P4Q7 775 aa11.58□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 GLT8D2Q9H1C3 349 aa11.58□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 SGMS1Q86VZ5 419 aa11.58□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 FSD2A1L4K1 749 aa11.58□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 FAM205CA6NFA0 338 aa11.58□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 CYP4A11Q02928 519 aa11.58□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa11.58□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 SSR1P43307 286 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 DRC1Q96MC2 740 aa11.58□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 AMNQ9BXJ7 453 aa11.58□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 HPS5Q9UPZ3 1129 aa11.58□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 ORC4O43929 436 aa11.58□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 CASP1P29466 404 aa11.58□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 STAT2P52630 851 aa11.58□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 GALNT17Q6IS24 598 aa11.58□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF341Q9BYN7 854 aa11.58□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 GPS2Q13227 327 aa11.57□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 IGSF22Q8N9C0 903 aa11.57□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM87AQ8NBN3 555 aa11.57□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 LZTFL1Q9NQ48 299 aa11.57□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 DNM3Q9UQ16 869 aa11.57□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 CSADQ9Y600 493 aa11.57□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 FDPSP14324 419 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 GRM4Q14833 912 aa11.57□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 FAM83BQ5T0W9 1011 aa11.57□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 ARHGEF16Q5VV41 709 aa11.57□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 AS3MTQ9HBK9 375 aa11.57□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 GAS7O60861 476 aa11.57□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 DCAF15Q66K64 600 aa11.57□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 SULF1Q8IWU6 871 aa11.57□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 FANCLQ9NW38 375 aa11.57□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 DNAI1Q9UI46 699 aa11.57□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 GPBP1Q86WP2 473 aa11.57□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 TEX35Q5T0J7 233 aa11.57□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 SLC39A2Q9NP94 309 aa11.57□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 STK36Q9NRP7 1315 aa11.57□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 CCDC169A6NNP5 214 aa11.56□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 PSMD14O00487 310 aa11.56□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 HOOK2Q96ED9 719 aa11.56□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 FAM212AQ96EL1 285 aa11.56□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 RPN1P04843 607 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 TTBK2Q6IQ55 1244 aa11.56□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 MYCT1Q8N699 235 aa11.56□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa11.56□□□□□ -0.56
TTPAL-201ENST00000262605 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms