RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635776.1

SCN1A-210, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SCN1A, Length 10,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1A-210ENST00000635776 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 MRIQ9BWK5 157 aa5.13□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 KCND1Q9NSA2 647 aa5.13□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 KCNG1Q9UIX4 513 aa5.13□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 RWDD2AQ9UIY3 292 aa5.13□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 MCM7P33993 719 aa5.13□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 AP3B2Q13367 1082 aa5.13□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 ZNF174Q15697 407 aa5.13□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 HHIPL2Q6UWX4 724 aa5.13□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 SLFN12Q8IYM2 578 aa5.13□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 LRWD1Q9UFC0 647 aa5.13□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 PTPAQ15257 358 aa5.13□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 HSP90B2PQ58FF3 399 aa5.13□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa5.13□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 KANSL2Q9H9L4 492 aa5.13□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 ATP8B1O43520 1251 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 TTLL1O95922 423 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 DNM2P50570 870 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 ETF1P62495 437 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 KCNB1Q14721 858 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 NFIXQ14938 502 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 CYP26C1Q6V0L0 522 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 CCDC65Q8IXS2 484 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 STK32BQ9NY57 414 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 SERPINB13Q9UIV8 391 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 FAM205AQ6ZU69 1335 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 IL1R1P14778 569 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 TNNI2P48788 182 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 CHAMP1Q96JM3 812 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 RIC8AQ9NPQ8 531 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 KRT86O43790 486 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 RPL13P26373 211 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 PTGDRQ13258 359 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 PANX2Q96RD6 677 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 TSGA10Q9BZW7 698 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 CCSER1Q9C0I3 900 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 CSRNP2Q9H175 543 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 NHSL1Q5SYE7 1610 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 SMCO2A6NFE2 343 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 SPDYE3A6NKU9 549 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 AFMP43652 599 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 DPCR1Q3MIW9 517 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 MAP9Q49MG5 647 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 KLHL10Q6JEL2 608 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa5.12□□□□□ -1.59
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SCN1A-210ENST00000635776 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa5.12□□□□□ -1.59
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SCN1A-210ENST00000635776 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 ZNF76P36508 570 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 MORC3Q14149 939 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 VWA3BQ502W6 1294 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 PRR5LQ6MZQ0 368 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
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SCN1A-210ENST00000635776 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 NT5DC1Q5TFE4 455 aa5.12□□□□□ -1.59
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SCN1A-210ENST00000635776 MYO6Q9UM54 1294 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 ASIC1P78348 528 aa5.12□□□□□ -1.59
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SCN1A-210ENST00000635776 VTI1AQ96AJ9 217 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 DEF6Q9H4E7 631 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa5.12□□□□□ -1.59
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SCN1A-210ENST00000635776 KCNQ2O43526 872 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 PRDX5P30044 214 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 PNOCQ13519 176 aa5.12□□□□□ -1.59
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SCN1A-210ENST00000635776 ALS2CR12Q96Q35 445 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 THAP9Q9H5L6 903 aa5.12□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 SHC4Q6S5L8 630 aa5.11□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 C16orf86Q6ZW13 317 aa5.11□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 IGSF22Q8N9C0 903 aa5.11□□□□□ -1.59
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SCN1A-210ENST00000635776 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP5.11□□□□□ -1.59
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SCN1A-210ENST00000635776 CETN1Q12798 172 aa5.11□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 EDEM3Q9BZQ6 932 aa5.11□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 URI1O94763 535 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 GNG11P61952 73 aa5.11□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 PDIA5Q14554 519 aa5.11□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 FAM47AQ5JRC9 791 aa5.11□□□□□ -1.59
SCN1A-210ENST00000635776 HAUS4Q9H6D7 363 aa5.11□□□□□ -1.59
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