RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
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SGMS1-210ENST00000619438 FOXP2O15409 715 aa25.05■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 PFKFB2O60825 505 aa25.05■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 AKR1B1P15121 316 aa25.05■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 USP14P54578 494 aa25.05■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 UBE2HP62256 183 aa25.05■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.05■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.05■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 CENPFP49454 3210 aa25.04■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 GUCY1A2P33402 732 aa25.04■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 ACER1Q8TDN7 264 aa25.04■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.04■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.03■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa25.03■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 BRF1Q92994 677 aa25.03■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.03■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 EVCP57679 992 aa25.02■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 GDPD2Q9HCC8 539 aa25.02■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 ATP2B2Q01814 1243 aa25.01■■□□□ 1.59
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SGMS1-210ENST00000619438 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.01■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 WDR19Q8NEZ3 1342 aa25.01■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 ICA1Q05084 483 aa25.01■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 PPARAQ07869 468 aa25.01■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.01■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa25■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 PRDM1O75626 825 aa25■■□□□ 1.59
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SGMS1-210ENST00000619438 FGD1P98174 961 aa25■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 CAP1Q01518 475 aa25■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 STK3Q13188 491 aa25■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa25■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.99■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 BCRP11274 1271 aa24.99■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 RASA1P20936 1047 aa24.99■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 PSMC4P43686 418 aa24.99■■□□□ 1.59
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SGMS1-210ENST00000619438 PPP1R9BQ96SB3 815 aa24.99■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 SH2D4AQ9H788 454 aa24.99■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 ELP1O95163 1332 aa24.98■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 A0A1W2PRG0 241 aa24.98■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 SCRN1Q12765 414 aa24.98■■□□□ 1.59
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SGMS1-210ENST00000619438 USP17L15C9J2P7 530 aa24.97■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.97■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 USP17L11C9JVI0 530 aa24.97■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 USP17L18D6R9N7 530 aa24.97■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 USP17L22D6RA61 530 aa24.97■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.97■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 USP17L19D6RCP7 530 aa24.97■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 USP17L20D6RJB6 530 aa24.97■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
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SGMS1-210ENST00000619438 USP17L24Q0WX57 530 aa24.97■■□□□ 1.59
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SGMS1-210ENST00000619438 LOC285556D6RIA3 1793 aa24.97■■□□□ 1.59
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SGMS1-210ENST00000619438 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.97■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.97■■□□□ 1.59
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SGMS1-210ENST00000619438 ZMYM6O95789 1325 aa24.96■■□□□ 1.59
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SGMS1-210ENST00000619438 VCAM1P19320 739 aa24.96■■□□□ 1.59
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SGMS1-210ENST00000619438 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.96■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC183Q5T5S1 534 aa24.96■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.96■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 TMX2Q9Y320 296 aa24.96■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 KIF3AQ9Y496 699 aa24.96■■□□□ 1.59
SGMS1-210ENST00000619438 FIBPO43427 364 aa24.95■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 JAK2O60674 1132 aa24.95■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 TSPY3P0CV98 308 aa24.95■■□□□ 1.58
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