RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 OSBPP22059 807 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 PDE4BQ07343 736 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 IFFO2Q5TF58 517 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 ERO1AQ96HE7 468 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 GIMAP6Q6P9H5 292 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 ATG4CQ96DT6 458 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 C19orf81C9J6K1 198 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 CFHR5Q9BXR6 569 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 BTBD7Q9P203 1132 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 B4E1Z4 1266 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 MCCP23508 829 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 ARID3AQ99856 593 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 FLT3LGP49771 235 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 KIF22Q14807 665 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 KCTD1Q719H9 257 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC17Q96LX7 622 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 CPVLQ9H3G5 476 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 TMX2Q9Y320 296 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 F5H6K3 240 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF213O14771 459 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 KDM4AO75164 1064 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 NDUFB10O96000 172 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 KLRC3Q07444 240 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 VCPKMTQ9H867 229 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 PNMA3Q9UL41 463 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 SZT2Q5T011 3432 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 CYP2B6P20813 491 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 MTFR1Q15390 333 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 CPXCR1Q8N123 301 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 USP17L15C9J2P7 530 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 USP17L11C9JVI0 530 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 USP17L18D6R9N7 530 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 USP17L22D6RA61 530 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 USP17L19D6RCP7 530 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 USP17L20D6RJB6 530 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 USP17L24Q0WX57 530 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIM32Q13049 653 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 GAS2L3Q86XJ1 694 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 RAET1EQ8TD07 263 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 KIFC2Q96AC6 838 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 MYPNQ86TC9 1320 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 USP14P54578 494 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC16A2P36021 539 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 POTEFA5A3E0 1075 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 CNMDO75829 334 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 ERVK-9P63128 1117 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 ERVK-24P63145 666 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 SGSM2O43147 1006 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 TTLL1O95922 423 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 CYP21A2P08686 494 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 FCGRTP55899 365 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 CCL14Q16627 93 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM110CQ1W6H9 321 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 SRRDQ9UH36 339 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 COG2Q14746 738 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 SLFN13Q68D06 897 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 SENP2Q9HC62 589 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM232C9JQI7 657 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 HIP1O00291 1037 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms