RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565243.2

RNPS1-213, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 2

Gene RNPS1, Length 3,337 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-213	ENST00000565243	SEMA3E	O15041	775 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	PDE8A	O60658	829 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	KRT2	P35908	639 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	MYO6	Q9UM54	1294 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	TTC26	A0AVF1	554 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	NMT2	O60551	498 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	MAP3K12	Q12852	859 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	ZMYND10	O75800	440 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	LAMB1	P07942	1786 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	KCNJ18	B7U540	433 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	N4BP3	O15049	544 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	CTAGE8	P0CG41	777 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	PRCP	P42785	496 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	KLK7	P49862	253 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	TROAP	Q12815	778 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	GPS2	Q13227	327 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	KCNJ12	Q14500	433 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	NELFB	Q8WX92	580 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	AK7	Q96M32	723 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	SCN7A	Q01118	1682 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	KRT9	P35527	623 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	WDR93	Q6P2C0	686 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	ZNF185	O15231	689 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	RPS6KA5	O75582	802 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	NDUFA10	O95299	355 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	TTC38	Q5R3I4	469 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	CCDC51	Q96ER9	411 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	HINFP	Q9BQA5	517 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	DCC	P43146	1447 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	PP2D1	A8MPX8	630 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	AGPS	O00116	658 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	USP14	P54578	494 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	PAK1	Q13153	545 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	CCDC102A	Q96A19	550 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	LAMB2	P55268	1798 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	RREB1	Q92766	1687 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RNPS1-213	ENST00000565243	RCAN1	P53805	252 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-213	ENST00000565243	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-213	ENST00000565243	FERMT2	Q96AC1	680 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-213	ENST00000565243	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-213	ENST00000565243	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-213	ENST00000565243	ERICH2	A1L162	156 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-213	ENST00000565243	POTEB2	H3BUK9	544 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-213	ENST00000565243	PSMD14	O00487	310 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-213	ENST00000565243	RNF40	O75150	1001 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-213	ENST00000565243	SLC5A1	P13866	664 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-213	ENST00000565243	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-213	ENST00000565243	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-213	ENST00000565243	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-213	ENST00000565243	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-213	ENST00000565243	MCM7	P33993	719 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-213	ENST00000565243	UBXN1	Q04323	297 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-213	ENST00000565243	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-213	ENST00000565243	PACS2	Q86VP3	889 aa		13.57	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms