RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560067.1

USP3-AS1-205, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 366 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-205ENST00000560067 ATG4CQ96DT6 458 aa14.65□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 STX8Q9UNK0 236 aa14.65□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 NMT2O60551 498 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 ELNP15502 786 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 CYP2B6P20813 491 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 PLS1Q14651 629 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLFN13Q68D06 897 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 POTEFA5A3E0 1075 aa14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 RGS2P41220 211 aa14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 ESR2Q92731 530 aa14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 NBPF3Q9H094 633 aa14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 IL25Q9H293 177 aa14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.63□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 VWA5AO00534 786 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 INHAP05111 366 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 BMP3P12645 472 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 ERCC3P19447 782 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 PTPREP23469 700 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 NT5C2P49902 561 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 MTFR1Q15390 333 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 MORN1Q5T089 497 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 SHCBP1Q8NEM2 672 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 RNF208Q9H0X6 261 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 FEM1BQ9UK73 627 aa14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 STRNO43815 780 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZBED4O75132 1171 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC25A27O95847 323 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 HMGCRP04035 888 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCL5P13501 91 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 MCCP23508 829 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 STAT3P40763 770 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC1A4P43007 532 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 MAP2K5Q13163 448 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 NCAPG2Q86XI2 1143 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 USP6NLQ92738 828 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 KIFC2Q96AC6 838 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 GMCL1Q96IK5 515 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 MROH8Q9H579 483 aa14.61□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 MYH8P13535 1937 aa14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 SGSM2O43147 1006 aa14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 NOVP48745 357 aa14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 BMP2KLQ5H9B9 411 aa14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 SKAP1Q86WV1 359 aa14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 TTC14Q96N46 770 aa14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 APBA2Q99767 749 aa14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 KRT23Q9C075 422 aa14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 MTMR7Q9Y216 660 aa14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 NEDD4P46934 1319 aa14.6□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 HTTP42858 3142 aa14.59□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM232C9JQI7 657 aa14.59□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 KDM4AO75164 1064 aa14.59□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 GJB1P08034 283 aa14.59□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 COPB2P35606 906 aa14.59□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 STAT2P52630 851 aa14.59□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 PTH1RQ03431 593 aa14.59□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 GRB14Q14449 540 aa14.59□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 RCSD1Q6JBY9 416 aa14.59□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 DPP9Q86TI2 863 aa14.59□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM160B2Q86V87 743 aa14.59□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 IQCA1Q86XH1 822 aa14.59□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.59□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRIB2Q92519 343 aa14.59□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.59□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 B4E1Z4 1266 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 FDX1P10109 184 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 FCER1AP12319 257 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCDC96Q2M329 555 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 136.4 ms