RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CS-204ENST00000546621 KCNG4Q8TDN1 519 aa8.9□□□□□ -0.98
CS-204ENST00000546621 ANKS1AQ92625 1134 aa8.9□□□□□ -0.98
CS-204ENST00000546621 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa8.9□□□□□ -0.98
CS-204ENST00000546621 DACT1Q9NYF0 836 aa8.9□□□□□ -0.98
CS-204ENST00000546621 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CS-204ENST00000546621 C10orf71Q711Q0 1435 aa8.9□□□□□ -0.98
CS-204ENST00000546621 MYH6P13533 1939 aa8.9□□□□□ -0.98
CS-204ENST00000546621 F8W031 263 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
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CS-204ENST00000546621 TSPY8P0CW00 308 aa8.9□□□□□ -0.99
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CS-204ENST00000546621 STK38Q15208 465 aa8.9□□□□□ -0.99
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CS-204ENST00000546621 DEFB132Q7Z7B7 95 aa8.9□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.9□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.9□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.9□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 FUCA2Q9BTY2 467 aa8.9□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 MXD3Q9BW11 206 aa8.9□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 CLSTN2Q9H4D0 955 aa8.9□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 KAT14Q9H8E8 782 aa8.9□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 DBNDD1Q9H9R9 158 aa8.9□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 IL17RBQ9NRM6 502 aa8.9□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 CLIC4Q9Y696 253 aa8.9□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 SNED1Q8TER0 1413 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 IRF6O14896 467 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 SPTLC2O15270 562 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 ECE2O60344 883 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 XBP1P17861 261 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 RASA1P20936 1047 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 KIF5BP33176 963 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 CDK8P49336 464 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 PKN1Q16512 942 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 MAP3K11Q16584 847 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 STRIP1Q5VSL9 837 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 HHIPL2Q6UWX4 724 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 OTUD6BQ8N6M0 293 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 KIF18AQ8NI77 898 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 TEKT1Q969V4 418 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 MAP3K14Q99558 947 aa8.89□□□□□ -0.99
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CS-204ENST00000546621 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 PCDHA7Q9UN72 937 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP8.89□□□□□ -0.996e-9■■■□□ 15.5
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CS-204ENST00000546621 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 A0A1W2PQ27 194 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 A0A1W2PQ64 194 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 A0A1W2PQD8 194 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 USP17L3A6NCW0 530 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 USP17L4A6NCW7 530 aa8.88□□□□□ -0.99
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CS-204ENST00000546621 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 TPM3P06753 285 aa8.88□□□□□ -0.99
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CS-204ENST00000546621 SCNN1DP51172 638 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 SEMA3FQ13275 785 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 ADALQ6DHV7 355 aa8.88□□□□□ -0.99
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CS-204ENST00000546621 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 NOSTRINQ8IVI9 506 aa8.88□□□□□ -0.99
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CS-204ENST00000546621 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
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CS-204ENST00000546621 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 KCNJ14Q9UNX9 436 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 SCN9AQ15858 1988 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 BTBD18B2RXH4 712 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 MAFGO15525 162 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 CCDC192P0DO97 292 aa8.87□□□□□ -0.99
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