RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 MYO6Q9UM54 1294 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 DUOX1Q9NRD9 1551 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 COBLO75128 1261 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 PCP11498 1178 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 CAPN2P17655 700 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 ACTN2P35609 894 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 VSNL1P62760 191 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 PDXDC2PQ6P474 469 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 TMTC3Q6ZXV5 915 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 ADGRA1Q86SQ6 560 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 CCDC148Q8NFR7 591 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 SLC4A9Q96Q91 983 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 SLF1Q9BQI6 1058 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 ABCF2Q9UG63 623 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 DISP2A7MBM2 1401 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 BCL9O00512 1426 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 UBXN1Q04323 297 aa10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 TROAPQ12815 778 aa10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 CASP8Q14790 479 aa10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 SUSD4Q5VX71 490 aa10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 ABL1P00519 1130 aa10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 RPN1P04843 607 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 IVLP07476 585 aa10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 CDC25AP30304 524 aa10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 NLRP5P59047 1200 aa10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 NPY5RQ15761 445 aa10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM71BQ8TC56 605 aa10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 BRIP1Q9BX63 1249 aa10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 ITGB4P16144 1822 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 H7C1D1 291 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 NDUFA10O95299 355 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 MCM3P25205 808 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 MCM7P33993 719 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 AMPD2Q01433 879 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 WDR93Q6P2C0 686 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 CCDC102AQ96A19 550 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 SLIT2O94813 1529 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 NHSL1Q5SYE7 1610 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 ABCA3Q99758 1704 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 TFRCP02786 760 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 LONP1P36776 959 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 CHRNDQ07001 517 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 OR8K1Q8NGG5 319 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 HAUS4Q9H6D7 363 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 SUGCTQ9HAC7 445 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 MED4Q9NPJ6 270 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 GUCA1BQ9UMX6 200 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 FAN1Q9Y2M0 1017 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 MYH2Q9UKX2 1941 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 PSMD14O00487 310 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 SCG2P13521 617 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 STAT6P42226 847 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 PARP10Q53GL7 1025 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 WWC2Q6AWC2 1192 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 NCAPH2Q6IBW4 605 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 MTRQ99707 1265 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 SMIM22K7EJ46 135 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 PRCPP42785 496 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 MAP9Q49MG5 647 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 EHBP1Q8NDI1 1231 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 CHP1Q99653 195 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 GDAQ9Y2T3 454 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF804BA4D1E1 1349 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 MYH8P13535 1937 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A1W2PQC6 194 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 LGALS16A8MUM7 142 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 PES1O00541 588 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 FGRP09769 529 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 CALML3P27482 149 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 KRT83P78385 493 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 STIM1Q13586 685 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 IL17AQ16552 155 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 MB21D1Q8N884 522 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 DNAJC7Q99615 494 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 VIPAS39Q9H9C1 493 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms