RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 PNMA2Q9UL42 364 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 AK9Q5TCS8 1911 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 C19orf81C9J6K1 198 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 IRF6O14896 467 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 ANTXR2P58335 489 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 FKBP1BP68106 108 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 GTF3C6Q969F1 213 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 ELP3Q9H9T3 547 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 ARAP2Q8WZ64 1704 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM232C9JQI7 657 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 FOXP2O15409 715 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 MAP3K13O43283 966 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 INPP5BP32019 993 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 GABPAQ06546 454 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 FAM160B2Q86V87 743 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 OTUD5Q96G74 571 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 F5H6K3 240 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 DEXIO95424 95 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 FGRP09769 529 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 OSBPP22059 807 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 KLRC3Q07444 240 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 ERO1BQ86YB8 467 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 KIF2CQ99661 725 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 ROBO3Q96MS0 1386 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 KIF13BQ9NQT8 1826 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 GOLGA8HP0CJ92 632 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 CALML3P27482 149 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 ADD1P35611 737 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 HUNKP57058 714 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 TATDN1Q6P1N9 297 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 KIFC2Q96AC6 838 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 FLOT1O75955 427 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 NAPAP54920 295 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 GRM4Q14833 912 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 AMHR2Q16671 573 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 LPAR1Q92633 364 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 NBPF3Q9H094 633 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 C6orf50Q9HD87 102 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 BRPF3Q9ULD4 1205 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 PPFIA3O75145 1194 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 WDR78Q5VTH9 848 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 ANKS1AQ92625 1134 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 GLT8D2Q9H1C3 349 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 VCPKMTQ9H867 229 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 FEM1BQ9UK73 627 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 CNTNAP1P78357 1384 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 SCRN1Q12765 414 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 SNAPC2Q13487 334 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 PLS1Q14651 629 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 KCTD1Q719H9 257 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 BICD2Q8TD16 824 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 MAP3K14Q99558 947 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 AKAP11Q9UKA4 1901 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 SMIM22K7EJ46 135 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 IFNAR1P17181 557 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 GNA11P29992 359 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 STAT2P52630 851 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 GUCY1B3Q02153 619 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 SEC23AQ15436 765 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 KLRG1Q96E93 195 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 IL17RAQ96F46 866 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 PNMA3Q9UL41 463 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 TMX2Q9Y320 296 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 DLEC1Q9Y238 1755 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 TRAF5O00463 557 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 PITPNM1O00562 1244 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 CXCL11O14625 94 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 WDR46O15213 610 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 STX6O43752 255 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 NDUFB10O96000 172 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 PTMSP20962 102 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 MAP2K5Q13163 448 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRO-210ENST00000544244 MTMR2Q13614 643 aa6.53□□□□□ -1.36
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