RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	NBPF11	Q86T75	865 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	SHISA3	A0PJX4	238 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	SRF	P11831	508 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	TCEAL1	Q15170	157 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	FXN	Q16595	210 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	CREG2	Q8IUH2	290 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125		Q8N3U1	123 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	SIGLEC6	O43699	453 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	DDAH1	O94760	285 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	LTK	P29376	864 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	ZP2	Q05996	745 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	DUSP13	Q9UII6	198 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	MEIS1	O00470	390 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	PRAMEF1	O95521	474 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	NCAPH	Q15003	741 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	PLCL1	Q15111	1095 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	HAUS7	Q99871	368 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	ST7	Q9NRC1	585 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	CHST7	Q9NS84	486 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-231	ENST00000544125	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	SHOX	O15266	292 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	ITGA4	P13612	1032 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	CD247	P20963	164 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	BRF1	Q92994	677 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	ARMC5	Q96C12	935 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	HDAC8	Q9BY41	377 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	GBP3	Q9H0R5	595 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	GP6	Q9HCN6	339 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125		B2RBV5	119 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	KLF4	O43474	513 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	ESR1	P03372	595 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	EGR3	Q06889	387 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	GAB4	Q2WGN9	574 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	TCTN2	Q96GX1	697 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	FGD4	Q96M96	766 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	DRC1	Q96MC2	740 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	PRR13	Q9NZ81	148 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	CBFA2T2	O43439	604 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	PPM1B	O75688	479 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	EPHX1	P07099	455 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	NAT2	P11245	290 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	FUT4	P22083	530 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF445	P59923	1031 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	RAB33A	Q14088	237 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	APBA2	Q99767	749 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	WHRN	Q9P202	907 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	GJB6	O95452	261 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	DDR2	Q16832	855 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	ABI1	Q8IZP0	508 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	FIBCD1	Q8N539	461 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-231	ENST00000544125	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29

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