RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTC1Q99614 292 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SENP2Q9HC62 589 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 DLX3O60479 287 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADAM11O75078 769 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNH1O95259 989 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NPTXRO95502 500 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CAPNS1P04632 268 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CD247P20963 164 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NTF4P34130 210 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGFALSP35858 605 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FLT3P36888 993 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ID4P47928 161 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PASD1Q8IV76 773 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF214Q8ND24 703 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTC8Q8TAM2 541 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BRF1Q92994 677 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SCLYQ96I15 445 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDH19Q9H159 772 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WHRNQ9P202 907 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TM4SF5O14894 197 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GFRA3O60609 400 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LILRB5O75023 590 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MYL1P05976 194 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAP2K3P46734 347 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNJ6P48051 423 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GAS6Q14393 721 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SETDB1Q15047 1291 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MLC1Q15049 377 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MSL1Q68DK7 614 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CNTD1Q8N815 330 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.46□□□□□ -1.38
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NEMP1O14524 444 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CREB3O43889 395 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ITGA4P13612 1032 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTLL4Q14679 1199 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 KSR2Q6VAB6 950 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM47Q96LD4 638 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IFT22Q9H7X7 185 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GP6Q9HCN6 339 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 E2F8A0AVK6 867 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 M0R082 166 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GABRDO14764 452 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SHOXO15266 292 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NEFMP07197 916 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PYGMP11217 842 aa6.44□□□□□ -1.38
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