RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CELA3AP09093 270 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CYP7A1P22680 504 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CHRNEQ04844 493 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LLGL2Q6P1M3 1020 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CRIP3Q6Q6R5 217 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMC6Q7Z403 805 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ANKS4BQ8N8V4 417 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DTWD2Q8NBA8 298 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GAL3ST3Q96A11 431 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-1018P-201ENST00000516577 VOPP1Q96AW1 172 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BRPF3Q9ULD4 1205 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SERINC4A6NH21 518 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 UPK3BL1B0FP48 263 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 UPK3BL2E5RIL1 263 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NRDCO43847 1150 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NEFLP07196 543 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RPL10P27635 214 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARHGAP4P98171 946 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CDSNQ15517 529 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 USHBP1Q8N6Y0 703 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LOXL4Q96JB6 756 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 USP40Q9NVE5 1235 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GPATCH2Q9NW75 528 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CEP131Q9UPN4 1083 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NUDT19A8MXV4 375 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HRKO00198 91 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PNLIPP16233 465 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PCNX4Q63HM2 1172 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LIPIQ6XZB0 460 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CEP128Q6ZU80 1094 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FNIP1Q8TF40 1166 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HHIPL1Q96JK4 782 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM87BQ96K49 555 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 COX4I2Q96KJ9 171 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF747Q9BV97 191 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FOXP3Q9BZS1 431 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CRTAC1Q9NQ79 661 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SUSD2Q9UGT4 822 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZMYM5Q9UJ78 669 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IRS2Q9Y4H2 1338 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM82A0PJX8 343 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GFRA2O00451 464 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NOBOXO60393 691 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ICMTO60725 284 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PGRP06401 933 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ATF2P15336 505 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SERPINB4P48594 390 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ERVFRD-1P60508 538 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DUSP4Q13115 394 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RAB3GAP1Q15042 981 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC14A2Q15849 920 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HDXQ7Z353 690 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 WAPLQ7Z5K2 1190 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PBXIP1Q96AQ6 731 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PPP4R2Q9NY27 417 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CYSRT1A8MQ03 144 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 H3BRB1 525 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FKTNO75072 461 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ETV3P41162 512 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MC3RP41968 323 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FOXO4P98177 505 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SEPT6Q14141 434 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LRRC14Q15048 493 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC6A19Q695T7 634 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RPTNQ6XPR3 784 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LIMS2Q7Z4I7 341 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAP6Q96JE9 813 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OSBPL7Q9BZF2 842 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LNPKQ9C0E8 428 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NLRP2Q9NX02 1062 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CYP8B1Q9UNU6 501 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MINPP1Q9UNW1 487 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CORINQ9Y5Q5 1042 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms