RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492283.1

RBMS1-215, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 5

Gene RBMS1, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-215	ENST00000492283	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	GRIN2C	Q14957	1233 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	SEPT2	Q15019	361 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	SBK1	Q52WX2	424 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	TICAM2	Q86XR7	235 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	SIPA1L1	O43166	1804 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	EVX2	Q03828	476 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	USP6NL	Q92738	828 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	PLXNB2	O15031	1838 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	AKR1B1	P15121	316 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	NUBP1	P53384	320 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	RTP1	P59025	263 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	PDE4B	Q07343	736 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	ACER1	Q8TDN7	264 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	ASB2	Q96Q27	587 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	SH2D4A	Q9H788	454 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	PTPRF	P10586	1907 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	MYH8	P13535	1937 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	USP17L15	C9J2P7	530 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	USP17L11	C9JVI0	530 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	USP17L18	D6R9N7	530 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	USP17L22	D6RA61	530 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	USP17L19	D6RCP7	530 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	USP17L20	D6RJB6	530 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	HIP1	O00291	1037 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	RAD21	O60216	631 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	USP17L24	Q0WX57	530 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	GSE1	Q14687	1217 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	CCL14	Q16627	93 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	BAD	Q92934	168 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	REV3L	O60673	3130 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	NCOR1	O75376	2440 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	SMIM22	K7EJ46	135 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	NEFL	P07196	543 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	SDS	P20132	328 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	ICA1	Q05084	483 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	FAM227B	Q96M60	508 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	LTBP2	Q14767	1821 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	DNM1L	O00429	736 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	PEX10	O60683	326 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	PRR29	P0C7W0	189 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	PPARA	Q07869	468 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	MORN1	Q5T089	497 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	LPAR1	Q92633	364 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283		A0A0D9SFI3	127 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	PRDM1	O75626	825 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	MAPK4	P31152	587 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	RGS2	P41220	211 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	HERVK_113	P62684	666 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	C12orf42	Q96LP6	360 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBMS1-215	ENST00000492283	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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