RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa18.97■□□□□ 0.63
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GCKP35557 465 aa18.93■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GLT8D2Q9H1C3 349 aa18.93■□□□□ 0.62
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP18.93■□□□□ 0.624e-7■■■□□ 16.7
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPP2R5DQ14738 602 aa18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF827Q17R98 1081 aa18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPATA5Q8NB90 893 aa18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NRBP1Q9UHY1 535 aa18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RGS12O14924 1447 aa18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PFKFB2O60825 505 aa18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAF5LO75529 589 aa18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATP5JP18859 108 aa18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CMA1P23946 247 aa18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCDHA7Q9UN72 937 aa18.92■□□□□ 0.62
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