RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 AGRPO00253 132 aa7.22□□□□□ -1.25
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PRPF40A-208ENST00000472760 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PRPF40A-208ENST00000472760 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PRPF40A-208ENST00000472760 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PRPF40A-208ENST00000472760 SDE2Q6IQ49 451 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF40A-208ENST00000472760 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PRPF40A-208ENST00000472760 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PRPF40A-208ENST00000472760 DAGLBQ8NCG7 672 aa7.16□□□□□ -1.26
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