RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446068.6

ARPP21-222, Transcript of cAMP regulated phosphoprotein 21, human

TSL 5

Gene ARPP21, Length 700 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARPP21-222	ENST00000446068	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ARPP21-222	ENST00000446068	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARPP21-222	ENST00000446068	ADGRF1	Q5T601	910 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARPP21-222	ENST00000446068	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ARPP21-222	ENST00000446068	TMC4	Q7Z404	712 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARPP21-222	ENST00000446068	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARPP21-222	ENST00000446068	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARPP21-222	ENST00000446068	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARPP21-222	ENST00000446068	TMEM74	Q96NL1	305 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARPP21-222	ENST00000446068	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARPP21-222	ENST00000446068	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARPP21-222	ENST00000446068	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ARPP21-222	ENST00000446068	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARPP21-222	ENST00000446068	KCTD3	Q9Y597	815 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARPP21-222	ENST00000446068		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068		E9PSI1	815 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	PEX10	O60683	326 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	IGSF3	O75054	1194 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	GART	P22102	1010 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	GBP1	P32455	592 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	NLRX1	Q86UT6	975 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	ASPN	Q9BXN1	380 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	COPRS	Q9NQ92	184 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	TMEM82	A0PJX8	343 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	TRIM13	O60858	407 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	FKTN	O75072	461 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	SEMA7A	O75326	666 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	EPHB3	P54753	998 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	CHRNE	Q04844	493 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	DUSP4	Q13115	394 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	SNX17	Q15036	470 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	ARSH	Q5FYA8	562 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	4.7	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	RELL1	Q8IUW5	271 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	TCTN2	Q96GX1	697 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	HDAC8	Q9BY41	377 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	RGS13	O14921	159 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	PI3	P19957	117 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	VMAC	Q2NL98	169 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	KCNC2	Q96PR1	638 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	OR14I1	A6ND48	311 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	SYP	P08247	313 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	MPP2	Q14168	576 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	RELT	Q969Z4	430 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	CRELD1	Q96HD1	420 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	MAP6	Q96JE9	813 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	SORBS3	O60504	671 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	PRAMEF1	O95521	474 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	RAG1	P15918	1043 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	VIPR1	P32241	457 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	CRK	P46108	304 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	SLC14A2	Q15849	920 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	BBS9	Q3SYG4	887 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	ZNF385B	Q569K4	471 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	MEIS1	O00470	390 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	NRDC	O43847	1150 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ARPP21-222	ENST00000446068	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66

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