RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 ESRRBO95718 433 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 RRM1P23921 792 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 CCND1P24385 295 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ME1P48163 572 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 CHD1LQ86WJ1 897 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 PLIN2Q99541 437 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC77Q9BR77 488 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 PLVAPQ9BX97 442 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 PDP2Q9P2J9 529 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 STOML1Q9UBI4 398 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 LDHCP07864 332 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 HVCN1Q96D96 273 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 NACAP1Q9BZK3 213 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF446Q9NWS9 450 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 KIF27Q86VH2 1401 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ANP32DO95626 131 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC166P0CW27 439 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 MYBL1P10243 752 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ATP4AP20648 1035 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ASPHQ12797 758 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 GRIK3Q13003 919 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 TRIML2Q8N7C3 387 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 RMND1Q9NWS8 449 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 KRT8P05787 483 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 KCNA3P22001 575 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 HDAC4P56524 1084 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ESRRGP62508 458 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD1Q15327 319 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 KCTD16Q68DU8 428 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 KIF6Q6ZMV9 814 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC8AQ8IWT6 810 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 VPS52Q8N1B4 723 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 NOD2Q9HC29 1040 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 TIMM44O43615 452 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 CHKAP35790 457 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 APBA1Q02410 837 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 P3H1Q32P28 736 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 PDXDC1Q6P996 788 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 STKLD1Q8NE28 680 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 AXIN1O15169 862 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 APOA4P06727 396 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 MXI1P50539 228 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 AP2B1P63010 937 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 SCRN3Q0VDG4 424 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC49Q8IUZ0 686 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 MKL1Q969V6 931 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 DHX58Q96C10 678 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC42Q96M95 316 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD27Q96NW4 1050 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 NDNQ99608 321 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 RSPH10B2B2RC85 870 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 EXOC5O00471 708 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 RSPH10BP0C881 870 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 ATP5DP30049 168 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 PTGS2P35354 604 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 UBASH3AP57075 661 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 IRF5Q13568 498 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 SPA17Q15506 151 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 NLRP7Q8WX94 980 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC138Q96M89 665 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.14□□□□□ -1.43
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