RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398035.6

COLCA2-201, Transcript of colorectal cancer associated 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COLCA2, Length 1,414 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2-201ENST00000398035 PTPRFP10586 1907 aa22.18■■□□□ 1.14
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COLCA2-201ENST00000398035 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
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COLCA2-201ENST00000398035 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.17■■□□□ 1.14
COLCA2-201ENST00000398035 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.17■■□□□ 1.14
COLCA2-201ENST00000398035 DGKHQ86XP1 1220 aa22.17■■□□□ 1.14
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COLCA2-201ENST00000398035 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.17■■□□□ 1.14
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COLCA2-201ENST00000398035 BMP3P12645 472 aa22.16■■□□□ 1.14
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COLCA2-201ENST00000398035 SLC25A27O95847 323 aa22.15■■□□□ 1.14
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COLCA2-201ENST00000398035 GPR142Q7Z601 462 aa22.15■■□□□ 1.14
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COLCA2-201ENST00000398035 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.15■■□□□ 1.14
COLCA2-201ENST00000398035 PORCNQ9H237 461 aa22.15■■□□□ 1.14
COLCA2-201ENST00000398035 MROH8Q9H579 483 aa22.15■■□□□ 1.14
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COLCA2-201ENST00000398035 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
COLCA2-201ENST00000398035 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.15■■□□□ 1.14
COLCA2-201ENST00000398035 PLA2G6O60733 806 aa22.14■■□□□ 1.14
COLCA2-201ENST00000398035 KDM4AO75164 1064 aa22.14■■□□□ 1.14
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COLCA2-201ENST00000398035 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.14■■□□□ 1.14
COLCA2-201ENST00000398035 FAM160B2Q86V87 743 aa22.14■■□□□ 1.14
COLCA2-201ENST00000398035 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
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COLCA2-201ENST00000398035 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.14■■□□□ 1.14
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COLCA2-201ENST00000398035 ZBED4O75132 1171 aa22.14■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 CDC45O75419 566 aa22.14■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 MCCP23508 829 aa22.14■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 PLS1Q14651 629 aa22.14■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 SKAP1Q86WV1 359 aa22.14■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.14■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.14■■□□□ 1.13
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COLCA2-201ENST00000398035 PEX10O60683 326 aa22.13■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 CYP21A2P08686 494 aa22.13■■□□□ 1.13
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COLCA2-201ENST00000398035 WDR78Q5VTH9 848 aa22.13■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 DCAF4Q8WV16 495 aa22.13■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 ANKS1AQ92625 1134 aa22.13■■□□□ 1.13
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COLCA2-201ENST00000398035 B4E1Z4 1266 aa22.12■■□□□ 1.13
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COLCA2-201ENST00000398035 STAT3P40763 770 aa22.12■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.12■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 MORN1Q5T089 497 aa22.12■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.12■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 ATP2A1O14983 1001 aa22.11■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 ERCC3P19447 782 aa22.11■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 PTPREP23469 700 aa22.11■■□□□ 1.13
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COLCA2-201ENST00000398035 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.11■■□□□ 1.13
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COLCA2-201ENST00000398035 KIFC2Q96AC6 838 aa22.11■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.11■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.11■■□□□ 1.13
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COLCA2-201ENST00000398035 RGS19P49795 217 aa22.1■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 OAZ1P54368 228 aa22.1■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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COLCA2-201ENST00000398035 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.1■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.1■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 MAP2K5Q13163 448 aa22.09■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 KAT14Q9H8E8 782 aa22.09■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.09■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 E7EWF7 191 aa22.08■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 FCER1AP12319 257 aa22.08■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 CYP2B6P20813 491 aa22.08■■□□□ 1.13
COLCA2-201ENST00000398035 GRB14Q14449 540 aa22.08■■□□□ 1.13
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