RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290921.10

CTBP1-201, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTBP1, Length 2,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-201ENST00000290921 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.53■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 LRRC10BA6NIK2 292 aa28.53■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 RHOXF2BP0C7M4 288 aa28.53■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 CALM1P0DP23 149 aa28.53■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 CALM2P0DP24 149 aa28.53■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 CALM3P0DP25 149 aa28.53■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 CDC25AP30304 524 aa28.53■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 NPY5RQ15761 445 aa28.53■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 RHOXF2Q9BQY4 288 aa28.53■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 ABCB6Q9NP58 842 aa28.53■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 FGRP09769 529 aa28.52■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 CAPN2P17655 700 aa28.52■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 COPB1P53618 953 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa28.52■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 E2F4Q16254 413 aa28.52■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 CYP26C1Q6V0L0 522 aa28.52■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 IQUBQ8NA54 791 aa28.52■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 RWDD2AQ9UIY3 292 aa28.52■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 ARHGAP25P42331 645 aa28.52■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 ZSCAN26Q16670 478 aa28.52■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 TMTC3Q6ZXV5 915 aa28.52■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 TAB2Q9NYJ8 693 aa28.52■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 L1RE1Q9UN81 338 aa28.52■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 RREB1Q92766 1687 aa28.51■■■□□ 2.16
CTBP1-201ENST00000290921 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 A0A0G2JS52 829 aa28.51■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 CTAGE15A4D2H0 777 aa28.51■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 DDAH1O94760 285 aa28.51■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 CTAGE8P0CG41 777 aa28.51■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 PCP11498 1178 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 LMAN1P49257 510 aa28.51■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa28.51■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 CTAGE6Q86UF2 777 aa28.51■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 CTAGE4Q8IX94 777 aa28.51■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.5■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.5■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 SIK1P57059 783 aa28.5■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 SPAG1Q07617 926 aa28.5■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 ITPK1Q13572 414 aa28.5■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 MYO1AQ9UBC5 1043 aa28.5■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 PAK1Q13153 545 aa28.5■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 UBE4AQ14139 1066 aa28.5■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa28.5■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 PIP4K2BP78356 416 aa28.49■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 TRIM14Q14142 442 aa28.49■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 TCP11X2Q5H9J9 407 aa28.49■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 PDXDC2PQ6P474 469 aa28.49■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 SLF1Q9BQI6 1058 aa28.49■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 SUGCTQ9HAC7 445 aa28.49■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 VPS18Q9P253 973 aa28.49■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 KCNJ18B7U540 433 aa28.49■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 KCNJ12Q14500 433 aa28.49■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 CTR9Q6PD62 1173 aa28.49■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa28.49■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa28.49■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF384Q8TF68 577 aa28.49■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 DLEC1Q9Y238 1755 aa28.48■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 VSNL1P62760 191 aa28.48■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
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CTBP1-201ENST00000290921 MTRQ99707 1265 aa28.48■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 KRT9P35527 623 aa28.48■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 CAVIN4Q5BKX8 364 aa28.48■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 MYH13Q9UKX3 1938 aa28.47■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.47■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 WWC2Q6AWC2 1192 aa28.46■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 GOLGA5Q8TBA6 731 aa28.46■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 MYO6Q9UM54 1294 aa28.46■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP28.46■■■□□ 2.151e-6■■■■□ 20.9
CTBP1-201ENST00000290921 IL17AQ16552 155 aa28.46■■■□□ 2.15
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CTBP1-201ENST00000290921 ZBTB9Q96C00 473 aa28.46■■■□□ 2.15
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CTBP1-201ENST00000290921 USP17L21D6R901 530 aa28.45■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa28.45■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 C3orf67Q6ZVT6 689 aa28.45■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 GBP3Q9H0R5 595 aa28.45■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
CTBP1-201ENST00000290921 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
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CTBP1-201ENST00000290921 MCM7P33993 719 aa28.45■■■□□ 2.14
CTBP1-201ENST00000290921 AMPD2Q01433 879 aa28.45■■■□□ 2.14
CTBP1-201ENST00000290921 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
CTBP1-201ENST00000290921 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
CTBP1-201ENST00000290921 CHP1Q99653 195 aa28.45■■■□□ 2.14
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF652Q9Y2D9 606 aa28.45■■■□□ 2.14
CTBP1-201ENST00000290921 SCN7AQ01118 1682 aa28.45■■■□□ 2.14
CTBP1-201ENST00000290921 UBXN1Q04323 297 aa28.44■■■□□ 2.14
CTBP1-201ENST00000290921 CASP8Q14790 479 aa28.44■■■□□ 2.14
CTBP1-201ENST00000290921 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
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