RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	KRT86	O43790	486 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	NGLY1	Q96IV0	654 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	PALLD	Q8WX93	1383 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	BAG3	O95817	575 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	CALM1	P0DP23	149 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	CALM2	P0DP24	149 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	CALM3	P0DP25	149 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	CALML3	P27482	149 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	LIFR	P42702	1097 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	BRINP3	Q76B58	766 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	CASP7	P55210	303 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	CYP27A1	Q02318	531 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	MAP9	Q49MG5	647 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	HDX	Q7Z353	690 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	PAGE5	Q96GU1	130 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	CEP89	Q96ST8	783 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	PP2D1	A8MPX8	630 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	RIMBP2	O15034	1052 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	IFT81	Q8WYA0	676 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	USP17L8	P0C7I0	530 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	GNPAT	O15228	680 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	SLFN14	P0C7P3	912 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	TEC	P42680	631 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	CUL4B	Q13620	913 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	FERMT2	Q96AC1	680 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	SCG2	P13521	617 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	13.22	□□□□□ -0.29	3e-6	■■■□□ 16.5
SPIN3-223	ENST00000639525	PNMA1	Q8ND90	353 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	SRGAP2	O75044	1071 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	ZSCAN26	Q16670	478 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	TFR2	Q9UP52	801 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	AGL	P35573	1532 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525		B4DLN1	442 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	POTEB2	H3BUK9	544 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	ZEB2	O60315	1214 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF76	P36508	570 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	SIK1	P57059	783 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	AMPD3	Q01432	767 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	NCAPH	Q15003	741 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	PRDX5	P30044	214 aa		13.21	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	RFC4	P35249	363 aa		13.21	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		13.21	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	TAF4B	Q92750	862 aa		13.21	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	USP17L3	A6NCW0	530 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	USP17L4	A6NCW7	530 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	ERFE	Q4G0M1	354 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	BLID	Q8IZY5	108 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	CXCR5	P32302	372 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	KRT83	P78385	493 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-223	ENST00000639525	KRT31	Q15323	416 aa		13.2	□□□□□ -0.3

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