RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584577.5

RPL38-208, Transcript of ribosomal protein L38, human

APPRIS ALT1 TSL 3 BASIC

Gene RPL38, Length 344 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL38-208	ENST00000584577	CHUK	O15111	745 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	PFKFB2	O60825	505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	ELN	P15502	786 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	CMA1	P23946	247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	SLC8A1	P32418	973 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	AMPH	P49418	695 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	ST5	P78524	1137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	MTX1	Q13505	466 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	ERFE	Q4G0M1	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	CNNM3	Q8NE01	707 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	P3H4	Q92791	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	PLVAP	Q9BX97	442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	TMX1	Q9H3N1	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	ST7	Q9NRC1	585 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	STK26	Q9P289	416 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	PTPRM	P28827	1452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	TRIM66	O15016	1216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	SPTLC2	O15270	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	CUTA	O60888	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	THBS1	P07996	1170 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	SPAG1	Q07617	926 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	DDR1	Q08345	913 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	STIM1	Q13586	685 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	TRIM29	Q14134	588 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	WASHC4	Q2M389	1173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	CCDC102B	Q68D86	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	PDILT	Q8N807	584 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	NECAB1	Q8N987	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	C3orf20	Q8ND61	904 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	SIRT1	Q96EB6	747 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	PGBD1	Q96JS3	809 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	GGA2	Q9UJY4	613 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	CRB1	P82279	1406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	CFAP99	D6REC4	459 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL38-208	ENST00000584577	CPLX1	O14810	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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