RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 SNX17Q15036 470 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 NKG7Q16617 165 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 GAB4Q2WGN9 574 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 NXPE4Q6UWF7 544 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 C3orf58Q8NDZ4 430 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 GCM1Q9NP62 436 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 PPM1HQ9ULR3 514 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 ZGLP1P0C6A0 271 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 GSTT1P30711 240 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 ETF1P62495 437 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 INPP5AQ14642 412 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 LRFN4Q6PJG9 635 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 PI16Q6UXB8 463 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 SPPL2CQ8IUH8 684 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD24Q8TF21 1146 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 RBCK1Q9BYM8 510 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 MYH16Q9H6N6 1097 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 C19orf44Q9H6X5 657 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRM-204ENST00000577468 PAGE1O75459 146 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 ETV3P41162 512 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 SERPINB4P48594 390 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP4.02□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 TPTE2Q6XPS3 522 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 PLPPR2Q96GM1 343 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 GPATCH2Q9NW75 528 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 PDE6BP35913 854 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 CHRNEQ04844 493 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 EGR3Q06889 387 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 SSPNQ14714 243 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 GORABQ5T7V8 394 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 RASIP1Q5U651 963 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 CDH24Q86UP0 819 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP4.01□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 SIGLEC10Q96LC7 697 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 SPATA32Q96LK8 384 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 SGPP1Q9BX95 441 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 DUSP13Q9UII6 198 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 IRAK3Q9Y616 596 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 TACC3Q9Y6A5 838 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 HRKO00198 91 aa4□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 BRD1O95696 1058 aa4□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
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PTPRM-204ENST00000577468 TIGD5Q53EQ6 642 aa4□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 FAM9BQ8IZU0 186 aa4□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 TEPSINQ96N21 525 aa4□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 GPR62Q9BZJ7 368 aa4□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 OR14I1A6ND48 311 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRM-204ENST00000577468 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 MARCH6O60337 910 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 PI3P19957 117 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 GRK4P32298 578 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 DUSP4Q13115 394 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 PCNX4Q63HM2 1172 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 SP8Q8IXZ3 490 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 ANKS4BQ8N8V4 417 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 XAGE3Q8WTP9 111 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 SGSM3Q96HU1 749 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 Q96M66 194 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 GPR160Q9UJ42 338 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 KCNH3Q9ULD8 1083 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 CARNS1A5YM72 827 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 SLC22A31A6NKX4 558 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 GIPC1O14908 333 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 LTKP29376 864 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 EFEMP1Q12805 493 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 SLC6A19Q695T7 634 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 RETREG2Q8NC44 543 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 PANK1Q8TE04 598 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 TERF2IPQ9NYB0 399 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 USTQ9Y2C2 406 aa3.98□□□□□ -1.77
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