RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 GBP3Q9H0R5 595 aa10.67□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 ADAM21Q9UKJ8 722 aa10.67□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 BCORQ6W2J9 1755 aa10.67□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A0U1RQJ8 604 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 CTAGE15A4D2H0 777 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 TUBBP07437 444 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 CTAGE8P0CG41 777 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 MCM6Q14566 821 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 KRT31Q15323 416 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 TTC38Q5R3I4 469 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 CTAGE6Q86UF2 777 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 CTAGE4Q8IX94 777 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 IQUBQ8NA54 791 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 ACRBPQ8NEB7 543 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 ATRIPQ8WXE1 791 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 ABHD10Q9NUJ1 306 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 ANAPC4Q9UJX5 808 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 H3BQF6 201 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 SNAP23O00161 211 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 ZBTB22O15209 634 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 PRDM1O75626 825 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 CALM1P0DP23 149 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 CALM2P0DP24 149 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 CALM3P0DP25 149 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 CYP7A1P22680 504 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 LMAN1P49257 510 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 BCAMP50895 628 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF174Q15697 407 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 ZSCAN26Q16670 478 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 RRAGBQ5VZM2 374 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 BRINP3Q76B58 766 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 SHISA4Q96DD7 197 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 PNKPQ96T60 521 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 RWDD2AQ9UIY3 292 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 BCL9LQ86UU0 1499 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 PLCH1Q4KWH8 1693 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 STRCP1A6NGW2 1772 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 PAK1Q13153 545 aa10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF34Q8IZ26 560 aa10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 GOLGA5Q8TBA6 731 aa10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 PDE11AQ9HCR9 933 aa10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM51Q9NW97 253 aa10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 RMND1Q9NWS8 449 aa10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 V9GY48 417 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa10.65□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa10.65□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 LRRC10BA6NIK2 292 aa10.65□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 COPB1P53618 953 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 GYS2P54840 703 aa10.65□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 ERVK-24P63145 666 aa10.65□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 FUT2Q10981 343 aa10.65□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 PTGDRQ13258 359 aa10.65□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 SDR42E1Q8WUS8 393 aa10.65□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 MYH6P13533 1939 aa10.65□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 XDHP47989 1333 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 PLEKHA8P1O95397 391 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 RHOXF2BP0C7M4 288 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 IQCA1Q86XH1 822 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 STAMQ92783 540 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 RHOXF2Q9BQY4 288 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 VPS16Q9H269 839 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 BLZF1Q9H2G9 400 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 ACBD3Q9H3P7 528 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 ABCB6Q9NP58 842 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 VPS18Q9P253 973 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 L1RE1Q9UN81 338 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 NUP98P52948 1817 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 KCNJ18B7U540 433 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 KCNJ12Q14500 433 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 E2F4Q16254 413 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 HSP90B2PQ58FF3 399 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 TCP11X2Q5H9J9 407 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 LEKR1Q6ZMV7 388 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 NELFBQ8WX92 580 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 TNFRSF25Q93038 417 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 TRERF1Q96PN7 1200 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 TAB2Q9NYJ8 693 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 WNT7AO00755 349 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 DDAH1O94760 285 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 KRT9P35527 623 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 ARHGAP25P42331 645 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 TRAPPC10P48553 1259 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 SLC20A2Q08357 652 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1-202ENST00000546471 CCDC152Q4G0S7 254 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms