RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543002.5

RABGGTA-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 1,329 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-203ENST00000543002 IQCA1Q86XH1 822 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 LPAR1Q92633 364 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 KCNB2Q92953 911 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 TTC14Q96N46 770 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 USP26Q9BXU7 913 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 GOPCQ9HD26 462 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 STX8Q9UNK0 236 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 VCAM1P19320 739 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 RASEFQ8IZ41 740 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 PCNTO95613 3336 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 F5H6K3 240 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 FOXN1O15353 648 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 TBC1D8O95759 1140 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 KLRC3Q07444 240 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 CRHR2Q13324 411 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 C8orf34Q49A92 452 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 PNMA3Q9UL41 463 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-203ENST00000543002 OSBPP22059 807 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 KRT32Q14532 448 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 DGKHQ86XP1 1220 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 MYH4Q9Y623 1939 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 USP17L15C9J2P7 530 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 USP17L11C9JVI0 530 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 USP17L18D6R9N7 530 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 USP17L22D6RA61 530 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 USP17L19D6RCP7 530 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 USP17L20D6RJB6 530 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 CYP2C8P10632 490 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 USP17L24Q0WX57 530 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 ANKS1AQ92625 1134 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 TNKSO95271 1327 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 RAD21O60216 631 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 TLR2O60603 784 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 NDUFB10O96000 172 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 MCCP23508 829 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 NEK1Q96PY6 1258 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 TSKSQ9UJT2 592 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 SEC24BO95487 1268 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 MCM5P33992 734 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 ANTXR2P58335 489 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 SEC23AQ15436 765 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 SLFN13Q68D06 897 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 MTA3Q9BTC8 594 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 CHST3Q7LGC8 479 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 GPR25O00155 361 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 PRC1O43663 620 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 GMCL1Q96IK5 515 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 ERICH2A1L162 156 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 HERVK_113P62684 666 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 COG2Q14746 738 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 C17orf99Q6UX52 265 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 TMEM87BQ96K49 555 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 KAT14Q9H8E8 782 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-203ENST00000543002 WDR19Q8NEZ3 1342 aa20.07■□□□□ 0.8
RABGGTA-203ENST00000543002 BMP3P12645 472 aa20.07■□□□□ 0.8
RABGGTA-203ENST00000543002 LBX1P52954 281 aa20.07■□□□□ 0.8
RABGGTA-203ENST00000543002 WTAPQ15007 396 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms