RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 TM4SF4P48230 202 aa21.98■■□□□ 1.11
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PTPRK-218ENST00000525459 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-218ENST00000525459 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-218ENST00000525459 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-218ENST00000525459 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-218ENST00000525459 ACER1Q8TDN7 264 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-218ENST00000525459 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa21.98■■□□□ 1.11
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PTPRK-218ENST00000525459 NMT2O60551 498 aa21.97■■□□□ 1.11
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PTPRK-218ENST00000525459 KAT14Q9H8E8 782 aa21.96■■□□□ 1.11
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PTPRK-218ENST00000525459 USP17L11C9JVI0 530 aa21.91■■□□□ 1.1
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PTPRK-218ENST00000525459 RAD21O60216 631 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRK-218ENST00000525459 USP17L24Q0WX57 530 aa21.91■■□□□ 1.1
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PTPRK-218ENST00000525459 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRK-218ENST00000525459 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRK-218ENST00000525459 DDAH1O94760 285 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRK-218ENST00000525459 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
PTPRK-218ENST00000525459 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
PTPRK-218ENST00000525459 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.89■■□□□ 1.1
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