RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 FDX2Q6P4F2 183 aa10.82□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 IGF2-ASQ6U949 168 aa10.82□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 ARMCX6Q7L4S7 300 aa10.82□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRN4CLQ8ND94 238 aa10.82□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 STAG1Q8WVM7 1258 aa10.82□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 LGR4Q9BXB1 951 aa10.82□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa10.81□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 LRIG2O94898 1065 aa10.81□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 THNSL2Q86YJ6 484 aa10.81□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP10.81□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 PLVAPQ9BX97 442 aa10.81□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM229AH3BQW9 127 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 PLD2O14939 933 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 RAPGEF3O95398 923 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 PLEKHG6Q3KR16 790 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 DNAJB8Q8NHS0 232 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 NEDD1Q8NHV4 660 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 GBP3Q9H0R5 595 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa10.8□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 CNGA1P29973 690 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 GMPRP36959 345 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKRD34AQ69YU3 496 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 LINC00114Q6XXX2 140 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP10.79□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 MFSD2AQ8NA29 543 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 CHAC2Q8WUX2 184 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A087X0B3 334 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 SHOXO15266 292 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 ELNP15502 786 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 STAT3P40763 770 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKRD39Q53RE8 183 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 LCE2CQ5TA81 110 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 SCUBE1Q8IWY4 988 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 CLUHP3Q96NS8 147 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 CEP131Q9UPN4 1083 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 TBX1O43435 398 aa10.77□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 CAPNS1P04632 268 aa10.77□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 FGFR1P11362 822 aa10.77□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 GRIA2P42262 883 aa10.77□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 C7orf61Q8IZ16 206 aa10.77□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 BVESQ8NE79 360 aa10.77□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 KREMEN1Q96MU8 473 aa10.77□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 WHRNQ9P202 907 aa10.77□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 KRBA1A5PL33 1030 aa10.76□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 F8W735 103 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 PRODHO43272 600 aa10.76□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 PPM1BO75688 479 aa10.76□□□□□ -0.69
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PGGT1B-205ENST00000514178 CD247P20963 164 aa10.76□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF4P78317 190 aa10.76□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 AUHQ13825 339 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 JAMLQ86YT9 394 aa10.76□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 VWCEQ96DN2 955 aa10.76□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 ACSS3Q9H6R3 686 aa10.76□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 CAAP1Q9H8G2 361 aa10.76□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 ENAMQ9NRM1 1142 aa10.76□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNQ2O43526 872 aa10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 PDE8AO60658 829 aa10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 PDGFRBP09619 1106 aa10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 RAB6AP20340 208 aa10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 PREPP48147 710 aa10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 NSMFQ6X4W1 530 aa10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM130Q8N3G9 435 aa10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 OSBP2Q969R2 916 aa10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 MRGPRX3Q96LB0 322 aa10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 MIPEPQ99797 713 aa10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 GP6Q9HCN6 339 aa10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 NOP56O00567 594 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 GNB5O14775 395 aa10.74□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 LETMD1Q6P1Q0 360 aa10.74□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 ADCY4Q8NFM4 1077 aa10.74□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 AKT3Q9Y243 479 aa10.74□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa10.74□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 EMC9Q9Y3B6 208 aa10.74□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 GSG1L2A8MUP6 293 aa10.73□□□□□ -0.69
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