RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493767.1

DYSF-218, Transcript of dysferlin, humanhuman

TSL 3

Gene DYSF, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSF-218ENST00000493767 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.49■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.49■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 TOMM22Q9NS69 142 aa21.49■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.49■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 CTGFP29279 349 aa21.48■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 NECTIN1Q15223 517 aa21.48■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 RCSD1Q6JBY9 416 aa21.48■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.48■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.48■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 KDM4AO75164 1064 aa21.47■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 BCRP11274 1271 aa21.47■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 USP14P54578 494 aa21.47■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.47■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 MKL1Q969V6 931 aa21.47■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 SLC27A2O14975 620 aa21.46■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 TTLL1O95922 423 aa21.46■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 PCP11498 1178 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa21.46■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.46■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 TXNRD2Q9NNW7 524 aa21.46■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.46■■□□□ 1.03
DYSF-218ENST00000493767 E7EWF7 191 aa21.45■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 NDUFB10O96000 172 aa21.45■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.45■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.45■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.45■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa21.45■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.45■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 HTTP42858 3142 aa21.44■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 PLXNB2O15031 1838 aa21.44■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 F5H6K3 240 aa21.44■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 KLRC3Q07444 240 aa21.44■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.44■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 FBXO28Q9NVF7 368 aa21.44■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 DOCK3Q8IZD9 2030 aa21.43■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 USP17L15C9J2P7 530 aa21.43■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.43■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 USP17L11C9JVI0 530 aa21.43■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 USP17L18D6R9N7 530 aa21.43■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 USP17L22D6RA61 530 aa21.43■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.43■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 USP17L19D6RCP7 530 aa21.43■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 USP17L20D6RJB6 530 aa21.43■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 FKTNO75072 461 aa21.43■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 CNMDO75829 334 aa21.43■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 ANTXR2P58335 489 aa21.43■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 HERVK_113P62684 666 aa21.43■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 USP17L24Q0WX57 530 aa21.43■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 FAM83BQ5T0W9 1011 aa21.43■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 CASC1Q6TDU7 716 aa21.43■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 RASEFQ8IZ41 740 aa21.43■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa21.43■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 LPAR1Q92633 364 aa21.43■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 ESR2Q92731 530 aa21.43■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 STX8Q9UNK0 236 aa21.43■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 OSBPP22059 807 aa21.42■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 SP3Q02447 781 aa21.42■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 TMEM47Q9BQJ4 181 aa21.42■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 SH2D4AQ9H788 454 aa21.42■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 SENP2Q9HC62 589 aa21.42■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 RBPJLQ9UBG7 517 aa21.42■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 WDR46O15213 610 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 RAD21O60216 631 aa21.41■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 CHST3Q7LGC8 479 aa21.41■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.41■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 TANGO6Q9C0B7 1094 aa21.41■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 GOPCQ9HD26 462 aa21.41■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 PNMA3Q9UL41 463 aa21.41■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 SEC23AQ15436 765 aa21.4■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 Q3C1V9 767 aa21.4■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 KRT23Q9C075 422 aa21.4■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 BTBD7Q9P203 1132 aa21.4■■□□□ 1.02
DYSF-218ENST00000493767 TNKSO95271 1327 aa21.39■■□□□ 1.01
DYSF-218ENST00000493767 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.39■■□□□ 1.01
DYSF-218ENST00000493767 SLFN13Q68D06 897 aa21.39■■□□□ 1.01
DYSF-218ENST00000493767 ATG4CQ96DT6 458 aa21.39■■□□□ 1.01
DYSF-218ENST00000493767 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
DYSF-218ENST00000493767 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.39■■□□□ 1.01
DYSF-218ENST00000493767 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
DYSF-218ENST00000493767 MORF4L1Q9UBU8 362 aa21.39■■□□□ 1.01
DYSF-218ENST00000493767 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.39■■□□□ 1.01
DYSF-218ENST00000493767 MCCP23508 829 aa21.38■■□□□ 1.01
DYSF-218ENST00000493767 LBX2Q6XYB7 198 aa21.38■■□□□ 1.01
DYSF-218ENST00000493767 KCNB2Q92953 911 aa21.38■■□□□ 1.01
DYSF-218ENST00000493767 TRIM47Q96LD4 638 aa21.38■■□□□ 1.01
DYSF-218ENST00000493767 MTMR7Q9Y216 660 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms