RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 SENP2Q9HC62 589 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 C19orf81C9J6K1 198 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 GTF2A2P52657 109 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 HMGCS2P54868 508 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 ATP2B2Q01814 1243 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 RUFY3Q7L099 469 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 TMEM87BQ96K49 555 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 FEZ1Q99689 392 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 SH2D4AQ9H788 454 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 VCPKMTQ9H867 229 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 LY9Q9HBG7 655 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 CEP350Q5VT06 3117 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 AOC2O75106 756 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 FBXL16Q8N461 479 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 CETPP11597 493 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 USP14P54578 494 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 GRM1Q13255 1194 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 NDUFB10O96000 172 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 LIFRP42702 1097 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 CCL15Q16663 113 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 GPAT2Q6NUI2 795 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 PTPN18Q99952 460 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 F5H6K3 240 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 VCAM1P19320 739 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 KLRC3Q07444 240 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 WTAPQ15007 396 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 RASGRP2Q7LDG7 609 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 LPAR1Q92633 364 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 GOPCQ9HD26 462 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 ERICH2A1L162 156 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 MAP2K2P36507 400 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 TREML2Q5T2D2 321 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 PNMA1Q8ND90 353 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-210ENST00000477812 BTBD19C9JJ37 291 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 SNHG28P0DPA3 235 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 TM4SF4P48230 202 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 GMCL1Q96IK5 515 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 KAT14Q9H8E8 782 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 INHBEP58166 350 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 SREBF2Q12772 1141 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 GADL1Q6ZQY3 521 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 Q6ZUG5 572 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 WDR46O15213 610 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 PDHBP11177 359 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 TROAPQ12815 778 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 SLFN13Q68D06 897 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD23Q86SG2 305 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 TMTC2Q8N394 836 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 PDRG1Q9NUG6 133 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 EVCP57679 992 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 IFNL1Q8IU54 200 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 DCAF4Q8WV16 495 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 BRF1Q92994 677 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 RLFQ13129 1914 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 PARP14Q460N5 1801 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 PCNTO95613 3336 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 DDAH1O94760 285 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 NEK4P51957 841 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 ZNF543Q08ER8 600 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 RABEP1Q15276 862 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 APOA5Q6Q788 366 aa23.34■■□□□ 1.33
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