RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476860.1

MFSD1-211, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MFSD1, Length 460 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-211ENST00000476860 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.15□□□□□ -1.42
MFSD1-211ENST00000476860 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.15□□□□□ -1.42
MFSD1-211ENST00000476860 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.15□□□□□ -1.42
MFSD1-211ENST00000476860 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.15□□□□□ -1.42
MFSD1-211ENST00000476860 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.15□□□□□ -1.42
MFSD1-211ENST00000476860 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.15□□□□□ -1.42
MFSD1-211ENST00000476860 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.15□□□□□ -1.42
MFSD1-211ENST00000476860 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa6.15□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.14□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.14□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.14□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.14□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.14□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 VPS37DQ86XT2 251 aa6.14□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.14□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa6.14□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 ANTXR1Q9H6X2 564 aa6.14□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.14□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.13□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.13□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.13□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 SLITRK5O94991 958 aa6.13□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 ARID5AQ03989 594 aa6.13□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 AOC3Q16853 763 aa6.13□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 ARSHQ5FYA8 562 aa6.13□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.13□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.13□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.13□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.13□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 EOMESO95936 686 aa6.12□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 FGRP09769 529 aa6.12□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 RAG1P15918 1043 aa6.12□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 SMARCA4P51532 1647 aa6.12□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 PKN1Q16512 942 aa6.12□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.12□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 KSR1Q8IVT5 923 aa6.12□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.12□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.12□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 ATG4CQ96DT6 458 aa6.12□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 FAM84AQ96KN4 292 aa6.12□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.12□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 HMGXB3Q12766 1538 aa6.11□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.11□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.11□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.11□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 CRBNQ96SW2 442 aa6.11□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.1□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 ETV3P41162 512 aa6.1□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.1□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.1□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 RIN3Q8TB24 985 aa6.1□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.1□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 SHDQ96IW2 340 aa6.1□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.1□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 GMLQ99445 158 aa6.1□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 SLC38A3Q99624 504 aa6.1□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 KIF2CQ99661 725 aa6.1□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.1□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.1□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 PEG3Q9GZU2 1588 aa6.1□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 TNFRSF10CO14798 259 aa6.09□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 RGS13O14921 159 aa6.09□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 TSPAN15O95858 294 aa6.09□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 GIPRP48546 466 aa6.09□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 CDH24Q86UP0 819 aa6.09□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 C1QL4Q86Z23 238 aa6.09□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.09□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.09□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.09□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 TM9SF2Q99805 663 aa6.09□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.09□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.09□□□□□ -1.43
MFSD1-211ENST00000476860 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.08□□□□□ -1.44
MFSD1-211ENST00000476860 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.08□□□□□ -1.44
MFSD1-211ENST00000476860 UBOX5O94941 541 aa6.08□□□□□ -1.44
MFSD1-211ENST00000476860 GUCY2CP25092 1073 aa6.08□□□□□ -1.44
MFSD1-211ENST00000476860 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.08□□□□□ -1.44
MFSD1-211ENST00000476860 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.08□□□□□ -1.44
MFSD1-211ENST00000476860 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.08□□□□□ -1.44
MFSD1-211ENST00000476860 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms