RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	KBTBD13	C9JR72	458 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	DNM1L	O00429	736 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	IGHD	P01880	384 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	ATP2B2	Q01814	1243 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	MAP2K5	Q13163	448 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	APPBP2	Q92624	585 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	LPAR1	Q92633	364 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	FEZ1	Q99689	392 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	DNAJC18	Q9H819	358 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	EYS	Q5T1H1	3165 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	LTBP2	Q14767	1821 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	FOSL2	P15408	326 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	USP5	P45974	858 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	RTP1	P59025	263 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	GABPA	Q06546	454 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	MORN1	Q5T089	497 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	LHX8	Q68G74	356 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	LCORL	Q8N3X6	602 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	PALD1	Q9ULE6	856 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	TTC28	Q96AY4	2481 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	GNAT2	P19087	354 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	USP14	P54578	494 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	USP6NL	Q92738	828 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	EVI5L	Q96CN4	794 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	VCAN	P13611	3396 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	USP17L15	C9J2P7	530 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	USP17L11	C9JVI0	530 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	USP17L18	D6R9N7	530 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	USP17L22	D6RA61	530 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	USP17L19	D6RCP7	530 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	USP17L20	D6RJB6	530 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	MBD4	O95243	580 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	USP17L24	Q0WX57	530 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	CCL14	Q16627	93 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	LNPK	Q9C0E8	428 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	PORCN	Q9H237	461 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	ARMT1	Q9H993	441 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	SWAP70	Q9UH65	585 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	RLF	Q13129	1914 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	PLCD1	P51178	756 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	JAG1	P78504	1218 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	SBK1	Q52WX2	424 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	MYLIP	Q8WY64	445 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	OSBP2	Q969R2	916 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	GDF11	O95390	407 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	PTPRE	P23469	700 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	SHH	Q15465	462 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	C12orf60	Q5U649	245 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	DPP9	Q86TI2	863 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	FSD1	Q9BTV5	496 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	BCL11A	Q9H165	835 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-223	ENST00000466245	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-223	ENST00000466245	GPAA1	O43292	621 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-223	ENST00000466245	CHGB	P05060	677 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-223	ENST00000466245	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-223	ENST00000466245	HOXC6	P09630	235 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-223	ENST00000466245		Q3C1V9	767 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-223	ENST00000466245	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-223	ENST00000466245	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49

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