RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 COG1Q8WTW3 980 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 CPLX3Q8WVH0 158 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 XAGE2Q96GT9 111 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 AGPSO00116 658 aa9.46□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 FSBPO95073 299 aa9.46□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 ABL1P00519 1130 aa9.46□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 TUBBP07437 444 aa9.46□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 BDNFP23560 247 aa9.46□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.46□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 OLFM4Q6UX06 510 aa9.46□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC30BQ8N4P2 665 aa9.46□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 KLC4Q9NSK0 619 aa9.46□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.46□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 SPTLC2O15270 562 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 STK10O94804 968 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 CRYMQ14894 314 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 AACSQ86V21 672 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 HMG20BQ9P0W2 317 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 HINFPQ9BQA5 517 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHL33A6NCF5 533 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 PDE4BQ07343 736 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 C11orf96Q7Z7L8 435 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 BOLA2Q9H3K6 86 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 PALLDQ8WX93 1383 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 HIP1O00291 1037 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 PDCLQ13371 301 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 TUBB2AQ13885 445 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 NAA25Q14CX7 972 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 ACRBPQ8NEB7 543 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 TUBB2BQ9BVA1 445 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 POLD4Q9HCU8 107 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 A1BGP04217 495 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 MYBL2P10244 700 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 CDC27P30260 824 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 SYKP43405 635 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 USP14P54578 494 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT32Q14532 448 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 PDIA6Q15084 440 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 E2F5Q15329 346 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf141Q5JVX7 400 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 WLSQ5T9L3 541 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 SELENOOQ9BVL4 669 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 TUBE1Q9UJT0 475 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 MYO6Q9UM54 1294 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GUA9 196 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 SEMA3EO15041 775 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 APBA3O96018 575 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 PDHBP11177 359 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC40Q4G0X9 1142 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 ZEB2O60315 1214 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 RTN2O75298 545 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 TAF5LO75529 589 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 RPSAP08865 295 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 GCKP35557 465 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 MAF1Q9H063 256 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP25P42331 645 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 CDR1P51861 262 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 TXNRD1Q16881 649 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 SCLT1Q96NL6 688 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC52A2Q9HAB3 445 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 MED23Q9ULK4 1368 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 TMCO5BA8MYB1 307 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-203ENST00000439720 ENC1O14682 589 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms