RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429968.5

RBM39-212, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 2,149 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-212ENST00000429968 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
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RBM39-212ENST00000429968 TYW1BQ6NUM6 668 aa16■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP16■□□□□ 0.156e-7■■□□□ 12.1
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RBM39-212ENST00000429968 BTDP43251 543 aa15.99■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 MAN1B1Q9UKM7 699 aa15.99■□□□□ 0.15
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RBM39-212ENST00000429968 IL1R1P14778 569 aa15.98■□□□□ 0.15
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RBM39-212ENST00000429968 TBC1D16Q8TBP0 767 aa15.98■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 MED15Q96RN5 788 aa15.98■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 CPVLQ9H3G5 476 aa15.98■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 TRIM75PA6NK02 468 aa15.98■□□□□ 0.15
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RBM39-212ENST00000429968 SMC2O95347 1197 aa15.98■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 ST5P78524 1137 aa15.98■□□□□ 0.15
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RBM39-212ENST00000429968 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa15.98■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 PNMA1Q8ND90 353 aa15.98■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 GGA1Q9UJY5 639 aa15.98■□□□□ 0.15
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RBM39-212ENST00000429968 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.156e-13■□□□□ 10.3
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RBM39-212ENST00000429968 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 RASGRP4Q8TDF6 673 aa15.97■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 MAD2L2Q9UI95 211 aa15.97■□□□□ 0.15
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RBM39-212ENST00000429968 RHBDL3P58872 404 aa15.97■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 ARMCX5Q6P1M9 558 aa15.97■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa15.97■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
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RBM39-212ENST00000429968 ARID3AQ99856 593 aa15.97■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 MYH8P13535 1937 aa15.96■□□□□ 0.15
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RBM39-212ENST00000429968 TMC6Q7Z403 805 aa15.96■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 MYRIPQ8NFW9 859 aa15.96■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 DHX58Q96C10 678 aa15.96■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 KAT14Q9H8E8 782 aa15.96■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 MKNK2Q9HBH9 465 aa15.96■□□□□ 0.15
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RBM39-212ENST00000429968 FAM13BQ9NYF5 915 aa15.96■□□□□ 0.15
RBM39-212ENST00000429968 TMEM232C9JQI7 657 aa15.95■□□□□ 0.14
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RBM39-212ENST00000429968 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 ATP2B4P23634 1241 aa15.95■□□□□ 0.14
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RBM39-212ENST00000429968 MXD3Q9BW11 206 aa15.95■□□□□ 0.14
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RBM39-212ENST00000429968 NRXN2Q9P2S2 1712 aa15.95■□□□□ 0.14
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RBM39-212ENST00000429968 SKILP12757 684 aa15.95■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 NLRP5P59047 1200 aa15.95■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 GSTO1P78417 241 aa15.95■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 MYL5Q02045 173 aa15.95■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 GRM4Q14833 912 aa15.95■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 TXNRD1Q16881 649 aa15.95■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.95■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 NT5DC1Q5TFE4 455 aa15.95■□□□□ 0.14
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RBM39-212ENST00000429968 ANKS1AQ92625 1134 aa15.95■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 TMEM47Q9BQJ4 181 aa15.95■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
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RBM39-212ENST00000429968 DGKHQ86XP1 1220 aa15.94■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 TEX2Q8IWB9 1127 aa15.94■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 TEX11Q8IYF3 940 aa15.94■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 CEP131Q9UPN4 1083 aa15.94■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 VWA3AA6NCI4 1184 aa15.94■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 SMTNL1A8MU46 457 aa15.94■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 C6orf229H3BNL8 230 aa15.94■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 AFMP43652 599 aa15.94■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 CDK8P49336 464 aa15.94■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 GOLGA8FQ08AF8 430 aa15.94■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa15.94■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 MORC3Q14149 939 aa15.94■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 STAMQ92783 540 aa15.94■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 STX8Q9UNK0 236 aa15.94■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RBM39-212ENST00000429968 MCM7P33993 719 aa15.93■□□□□ 0.14
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